吴三桂自然会得到当时条件所能允许的最好的治疗。虽说未见太好，却也维持下去，未见恶化。不幸的是，有一天，忽然有条狗窜到他的几案上，安祥地端坐着。吴三桂先是吓了一跳，马上意识到狗坐几案是不祥之兆。他很迷信，又经狗惊吓，精神一下子垮了下来，病情迅速恶化，口不能张。说明他初得此病时，口尚能开合，而此时却不能张口。
接着，他又添了“下痢”的病症，中医称痢疾，泄泻不止。
请郎中百般调治，终不见效。吴三桂知道自己不行了，授意他的心腹大臣，速命他的孙子吴世（即吴应熊的儿子）来衡州，托付后事。
除此遗命，吴三桂对未来之事大概没有留下什么要紧的话，这在他死后诸将讨论大计时，各持一说，已见吴三桂死前未予指示今后的出路。看来，他不想说出他不愿说的话，一切听天由命，听凭他们主持吧。他自知是将死之人，心灰意冷，还能绐他们留下什么话呢？或许口不能张，说不了话？或许他想等到孙子从云南来衡州时一并说？反正，他没有留下什么遗言，是可以肯定的。
信使从衡州到云南，再从云南携世回到衡州，路途何其遥远！吴三桂的病继续恶化，还未等到世来到，便于八月十八日病逝了，享年67岁。这年正是康熙十七年。吴三桂带着他的遗恨离开了人世。他的轰轰烈烈的一生，在凄惨中结束了。至此，作为他个人的历史已经完结。他没有留给子孙和臣属们丰厚的遗产，而是一个烂摊子，亟待收拾的残局，并且把必不可免的灭族之祸转嫁给了他们！
吴三桂的死，不用说，对他的子孙和臣属们是很不利的。今后向何处去，作何打算？他们中无论哪个人都不能作出决定。况且还有一些至关重要的将领仍在前方指挥作战，必须让他们参与大事。留在衡州的将领密议，派专使紧急把在前方的核心人物都召集到衡州后，再定大计。为防止因吴三桂之死而导致军心涣散和动摇，更防备不测事件发生，他们下令，将衡州城门关闭，禁止出入，也不发丧，把吴三桂的死暂时隐瞒起来。为遮人耳目，每天令仆从照旧给吴三桂进奉衣食，如平时一样，好像什么事也没有发生过。被蒙在鼓里的衡州军民，只觉得关闭城门太突然，也猜不出发生了什么事，都没想到吴三桂已经死了。当然，清朝方面更无从知道了。
过了四天，正在永兴等处的胡国柱、马一宝等接到密令，率部疾速回衡州。吴国贵也差不多同时赶到。待核心人物到齐，城门才开，照常通行旅。守永兴的清将领报告：从八月二日到二十日，马一宝等部逼永兴，满汉官兵日夜坚守，屡退吴军。二十一日夜，忽见马一宝等所有吴军焚毁营寨，慌忙整队撤退。直到八月末，他们才知道这其中的缘故。
吴三桂的侄、婿与心腹将领齐聚衡州，公推吴国贵总理军务，派胡国柱回云南，迎吴世前来衡州奔丧。胡国柱到达云南，向留守的郭壮图传达众将的意见；准备护送吴世
去衡州。郭壮图当即表示反对，他认为云南为根本重地，吴世不能轻易出国门。胡国柱极力说服，郭壮图根本不听，以为可弃湖南，守险隘，犹可以在云南作“夜郎王国”，力阻吴世离开云南。胡国柱气急大哭，在城外东郊徘徊数日，痛哭流涕，郭壮图丝毫不为所动。实际上，郭壮图有自己的打算。她有一个女儿嫁给了吴世，三桂一死，吴世
必然即位，立皇后。与她的女儿争皇后的还有卫朴的女儿。
郭壮图力图把吴世控制在自己手里，因此就不准他去衡州。胡国柱无奈，哭着离云南而去。
胡国柱走后，吴国贵召集并主持诸将会议，讨论今后的方针大计。吴国贵首先发表见解，说：“从前所为大误！今日大计，应该舍弃云南而不顾，北向以争天下：以一军图荆州，略襄阳，直趋河南；一军下武昌，顺流而下，经略江北。吾辈勿畏难，勿惜身，宁进死，勿退生，拼死决战，剜中原之腹心，断东南之漕运，即令不能混一，黄河以南，我当有之。”
