叶超安排两名刑警守住洞口，自己带领胡海和田华进洞搜索。田华的痕迹鉴定经他的师父省痕迹专家曲波的悉心指导，有了很大的进步，叶超让田华走在前面搜索，这时天色渐渐暗下来了，洞内一片漆黑，这里又出现过几起凶杀案，显得有些阴森恐怖。田华打开强光手电筒仔细搜索，他在监控视频里观察了武长甲的身高体重，特别观察了他穿的鞋，是一双耐克运动鞋。这是名牌运动鞋，价格昂贵，穿的人很少。田华已经牢记了各种品牌鞋的脚印，虽然洞内游人的脚印很多，但耐克运动鞋的脚印肯定不多，田华认为现在他的重点是搜索耐克运动鞋的脚印。同时他也通过监控视频观察到林海穿的是一双李宁牌跑鞋，而另一名歹徒穿的是一双北京牌布鞋。
第一号洞内没有发现耐克运动鞋的脚印，第二个洞内也没有发现耐克运动鞋的脚印。当快进入第三号洞口时，田华发了耐克运动鞋的脚印，他仔细观察发现与武长甲的身高体重的鞋码相吻合，他示意叶超和胡海注意观察，自己跟着脚印往洞内仔细搜索。
三号洞比一号和二号洞弯曲复杂，洞壁也是怪石峥嵘，还有不少猫儿洞，对好奇的游客很有吸引力，因此洞内脚印零乱，但田华仍能从杂乱的脚印里寻觅跟踪前进。走到洞内最后一个弯道时，耐克运动鞋的脚印不见了，这里因为太深和太黑暗，游客很少，因此脚印很少，耐克运动鞋的脚印就更明显了，同时也发现北京牌布鞋的脚印，可没有发现李宁跑鞋的脚印。但从脚印观察，穿北京牌市鞋的脚印是一个负重人的脚印，田华判断他身上背着一个人，这个人可能就是昏迷的林海博士，但是这两个人的脚印到这里就清失了，没有发现出洞的脚印。田华思考了一下后在叶超的耳边轻声说道：“这里可能有暗洞或者地道。”叶超点头表示赞同，示意胡海一起寻找暗洞的洞口。
叶超认为这里都是怪石峥嵘的石头，如果有暗洞必定有机关打开洞门，他们仔细观察，发现有一块拳头大小的石头和別的石头颜色不同，而且有人多次摸过的痕迹，他判断这个可能就是机关，田华和胡海也仔细观察，田华在石头上发现了指纹，时间大约十多小时。这样叶超更加坚信这是机关，叫田华和胡海退后，并做好准备，自己用力拧动石头，果然是一个机关，只见随着石头的转动，脚下露出一个漆黑的洞口。叶超用强光手电筒照射，发现洞口有阶梯直通洞底，洞底有一条地道。
叶超看着这个黑漆漆的洞口感到问题很严重，他已经在原始森林里同蝙蝠帮交过手，这股黑恶势力心狠手辣，而且拥有枪支，入洞搜索是一项非常危险的任务。在指挥部坐镇指挥的闵江局长通过视频也看到了暗洞和暗道，指示入洞搜索的人员一律穿防弹衣，戴钢盔，夜视镜，配备抢支，闵局长说马上派人送到，并增派出四名特警支援。
不久四名特警赶到，叶超等刑警穿上防弹衣，进入暗道搜索，暗道不宽，刚够一个人通过。特警左手持防弹盾牌，右手端着手枪往前搜索。暗道里没有发现密室，也没有弯道，只是一个简单的暗道，只有一百多米长，出口是一扇铁门，铁门已经上锁。叶超用红外线激光仪探测门后没有人员看守，胡海用刑警的特制开锁工具打开铁门，又发现了一个机关。叶超小心翼翼地拧动开关，头顶上一块大石板缓缓转动，立刻传来古庙里的诵经声。叶超知道已经到达古庙内，他探出头看了看，没有发现有人看守，便钻出了暗道，发现是古庙的后院。因为这时天已经全黑了，后院一片漆黑，刑警们的到来没有被人发现。
叶超叫大家隐蔽好，自己同胡海和田华悄悄对古庙侦察了一番，发现古庙因时代久远，逐渐发展，古庙很大，分前中后三个大院。前院是大殿，供香客和信徒朝拜和做法事。中院也有大殿，供僧人诵经坐禅，后院是僧人们居住生活地方。寺庙古树参天，建筑坚固美观，苍桑而古朴。今天因为富人为母亲超度花了大价钱，法事规模宏大，时间漫长，可能通宵达旦，所有的僧人都集中在前殿诵经祈祷。后院静悄悄无一个人影。
叶超判断蝙蝠帮已经对史国华和周芳的美人计已经失去了耐心，他们见扑克帮企图以绑架的形式逼沈光博士交出M1芯片，自己也用强硬手段绑架林海博士，也企图逼迫林海博士交出M1芯片，这就需要有电脑和网络。叶超同胡海和江华仔细观察，田华使出他的痕迹鉴定本事，发现后院的藏经楼符合这个条件，田华已发现了有网络线路进入了藏经楼。而且藏经楼里有灯光，这么晚了，僧人们都在前大殿里诵经，怎么会有人在藏经楼里。叶超估计就是武长甲把林海绑架在藏经楼内。
藏经楼高二层，石头筑墙，木檐瓦顶，十分坚固。现在大门紧闭，窗户很小，又拉上了窗帘，遮挡得严严实实的，楼内的情况不明。叶超知道古老的盖瓦的房顶必定有玻璃明瓦，他和一名特警攀上房顶，果然看到了有几片明瓦，轻手轻脚来到明瓦前往下观看，可是武长甲很狡猾，他已经发现房顶上的明瓦，知道警察攀爬这个楼房如履平地，可以通过明瓦覌察藏经楼内的情况。已经在对明瓦进行遮光，叶超无法通过房顶的明瓦观察藏经楼内的情况。
叶超认为弄不清藏经楼内的情况就无法安全地营救林海，他想现在只有请求古庙的僧人想办法。他在侦办随缘和尚的案件时了解到古庙的主持云法大师是一个心慈面善，德高望重的高僧，极力反对黑恶势力利用寺庙行凶作恶，曾多次清理过涉黑的和尚。武长甲利用寺庙绑架人质一事一定与他无关，现在有困难请他帮助一定会同意的。叶超决定同云法大师谈谈，恳请他帮助。
云法大师年事已高，庙内的法事一般都是他的大弟子圆智主持，此时他正坐在禅房内坐禅。叶超和胡海在护法的带领下来到禅房拜见云法大师，向他说明来意，请求他的帮助。云法大师得知寺庙内有和尚和黑恶势力有关系，还利用寺庙的防空地道绑架人质，非常气愤。不过他是一个高僧，修养极好，并设有发火，而是和颜悦色地和叶超打招呼，问叶超需要怎么支持。叶超说急需弄清藏经楼内的情况。
云法大师说：“这个好办，我寺每天晚上护法僧人都要对全寺进行巡视，检查全寺的安全问题，我交代护法僧人仔细观察后告诉你们。”
叶超向云法大师请求让自已扮成护法僧人进入藏经楼巡视。慧能大师说不行，因为护法僧人大家都认识，而且僧人都要剃头烧戒疤，你们一时难以做到。但云法大师也懂一点现代科技，他把护法僧圆道叫来，让他借巡视安全为由，順便帮助警察安放两个微型摄像头和窃听器。
圆道护法武功高强，他趁巡视之机，在藏经楼一楼和二楼的隐蔽处都安放了微型摄像头和窃听器。解救小组通过摄像头对藏经楼内的情况看得很清楚，立即制定了营救方案，经指挥部同意后营救林海博士。
