送走王镇恶、孟龙符两路大军,杨安玄并没有闲着，陆续在棋盘上落下六子。
第一颗棋子是让暗卫化装成商贾前往南凉、北凉，一路散播秦国大兵攻打雍州，国内空虚的言论。
南凉景王秃发傉檀和北凉武宣王沮渠蒙逊原本合力攻打后凉建康公吕隆，吕隆抵御不住，索性献土向后秦归顺，请求后秦军队迎他入长安。
姚兴喜从天降，派尚书左仆射齐难、镇西将军姚诘等人率军四万前去迎接吕隆归顺。前往后凉要通过南凉国土，秃发傉檀迫于后秦实力强大，只得让出道路让兵秦军队通过前往姑臧接吕隆进长安。
后凉国灭，吕隆为报复北凉和西凉,力劝齐难攻打两国，结果齐难前锋战败，只得与两国结盟互不侵犯，齐难以司马王尚为凉州刺史，率军三千镇守姑臧。
姚兴是高兴了，北凉和南凉到嘴的肉被人夺了，自然心怀不满，但怯于后秦实力雄厚不敢声张，得知秦国内部空虚，难免要蠢蠢欲动起来。
第二颗棋子放在当阳。杨安玄占据当阳后,命宁远将军严壮率军五千镇守，秦军攻雍，杨安玄猜测桓玄极可能从江陵出兵夹击，当阳城兵力不足。
杨安玄命傅弘之统军三千前往当阳，协助严壮防御荆州兵马，吩咐傅弘之若事不可违,不妨放弃当阳退守编县，届时他会亲率大军前往增援。
当阳城如同楔入桓玄体内地一颗钉子，既可威胁江陵又可让雍州水师东进，杨安玄准备看准时机，兵发寻阳夺取司马德宗。
第三颗子落在宁益两州，杨安玄送信给益州刺史毛璩和宁州刺史毛璠，痛述桓玄谋朝篡位，邀两人一起举兵伐桓，迎天子还朝。
杨安玄很有把握毛璩会举兵呼应，只要益州举起反桓大旗，荆州、梁州必被牵制，雍州不再向前年那样有西面之忧，而当阳地作用越发重要。
第四颗棋子用来针对刘裕，自己穿越到东晋当然不能眼睁睁地看着刘裕建立刘宋，晋失其鹿，有志者逐之，何况自己还占了先机。不好明目张胆地对付刘裕，不妨用上些小手段。
第五颗棋子是写给阴友齐的信，黄门侍郎阴友齐作为阴贵妃地父亲，桓玄篡位之后自然遭到冷置。天子即将出京前往寻阳，杨安玄建议阴友齐随天子一同前往，一来可以显示不忘旧主忠贞可嘉；二来能够照顾阴慧珍；最重要地是能够为杨安玄夺取司马德宗作为耳目。
第六颗子派丁全、黄富派人暗潜入京口、广陵两地，这两地是北府军地基地，刘裕要反桓必定要借重北府军相助。自己鞭长莫及无法出兵介入，但桓修身死后朱龄石可不容错过，凭自己与他的交情，或许可以邀他前来襄阳，顺便让朱龄石带一批人前来。
十二月二十二日，司马德宗带着晋室先祖的灵位前往寻阳(1)，改任平固王友的阴友齐随行；十二月二十四日，桓玄将桓温的神主放入太庙之中，代晋的整个步骤宣告完成。
永始二年(元兴三年)在风雨飘摇中到来。正月，桓玄册封正妻刘氏为皇后，诏方镇刺史入京觐见，并下旨让各方镇向朝庭推荐有用之才。
方镇之中雍州是桓玄的最大心患，如今秦国依诺发兵，桓玄不复为忧，接下来便是益、宁两州的毛家兄弟。
桓玄决定先对付益州刺史毛璩，下诏加封毛璩为散骑常侍、左将军，命毛璩入京觐见。同时，桓玄下旨调梁州刺史苻宏进京，以桓希为代之，并暗中下旨调动兵马，准备将毛璩围困在益州境内。
毛璩收到杨安玄的来信，正犹豫不决，看到桓玄召他进京的诏书，知道进京之后性命便操于桓玄手中，而王异驻涪县、郭法守宕渠、周道子镇白帝等举动无不说明桓玄对自己防备甚深。
毛璩勃然大怒，扣押桓玄使者，响应杨安玄号召，传檄声讨桓玄，派巴东太守柳约之、建平太守罗述和征瞄司马甄季之先下手为强，趁桓希尚未到任之季，先行击败王异、郭法等人，占据梓潼郡，封闭了蜀道，进驻白帝城。
建康，桓玄在朝政上并无新意，诏令纷纭，百官奉答不暇。桓玄性情苛刻琐碎，对小节吹毛求疵，因尚书奏疏中误将“春蒐”写成“春菟”而将经手之人尽皆降黜，以显示他的高明。
