李膺、杜密、翟超、刘儒、荀翌、范滂、虞放等百余人被下狱处死。在各地陆续被逮捕、杀死、流徙、囚禁的士人达到六、七百名。汝南督邮吴导奉诏前往逮捕范滂，到了范滂的家乡，竟趴在驿舍的**大哭，范滂听说后说道：“一定是因为我才会这样。”于是便要亲自前往监狱。汝南县令郭揖听说后解掉印绶，跟范滂一起逃跑。范滂说道：“我死了祸事就结束了，怎么敢连累您呢？”范滂与母亲诀别，范母对范滂说道：“儿今日能与李膺、杜密齐名，死亦何恨？”遂与李膺、杜密等百馀人被执，庾死。
此前曾得罪宦官的张俭四处流亡，在路途上看见人家就前往投宿，每户人家即便知道会引来杀身之祸也愿意收留他。张俭在众人的帮助下得以逃亡塞外。因为收留他而被追究灭门的前后有数十家之多，宗族亲戚都被杀害，郡县因此残破不堪。
这就是臭名昭著的第二次党锢之祸。
八年之后，熹平五年闰五月，永昌太守曹鸾上书为党人鸣冤，要求解除禁锢。灵帝不但没有听从，反而收捕并处死曹鸾。接着灵帝又下诏书：凡是党人门生、故吏、父子、兄弟中任官的，一律罢免，禁锢终身，并牵连五族。
党锢之祸的范围扩大，波及更多的无辜者。直到中平元年春二月，黄巾之乱的兴起，一夜间天下震动，各地盗贼四起，纷纷攻打郡县焚烧官府。灵帝怕党人与黄巾一同作乱，遂于夏四月丁酉日大赦天下，免除了亲属关系与党人在小功以外者的禁锢。
一直到了五年后灵帝病死，少帝刘辨继位，外戚何进担任大将军后执掌朝政大权，试图谋诛除擅权的宦官张让，赵忠等人，反被宦官诱入后宫杀害。为替何进报仇，豪族出身的官僚袁绍领兵冲入皇宫，把宦官杀戮殆尽，结束了外戚宦官长期专权的局面，史称十常侍之乱。五个月后董卓带兵入宫，废少帝立献帝，派使者吊祭陈蕃、窦武等人，事隔整整二十二年，东汉朝廷才算正式为陈窦等人平反，党锢之祸终于落下帷幕。
桓、灵二帝之前，宦官、外戚虽然交替专权，但有名臣陈蕃等人主持朝政大局，士大夫、豪强等心向朝廷，局势尚未到不可收拾的境地。但两次党锢之祸后，清正的官员不是被害就是被禁锢，宦官更加为所欲为，残害百姓，因而激起民变，最终酿成黄巾之乱。士大夫、豪强离心，于是黄巾之乱以后群雄并起，东汉最终走向了灭亡。只不过这就是后话了。
在第二次党锢之祸时，灵帝大肆杀害天下豪杰和儒学行义之人，王芬不得不再度流亡藏匿。前后禁锢长达十九年。黄巾之乱爆发后，在中郎将皇甫嵩、中常侍吕强的建议下，灵帝废除了对党人的禁锢。一大批忠正之臣重新被起用，王芬也被任命为冀州刺史，前往冀州治理黄巾军根源。
王芬到任后收纳流民，安抚叛乱，治军理政，很快使冀州安定下来。在州四年，民生富饶。黄巾之乱平定后，被朱震藏到甘陵而躲过一难的三君之首陈蕃的儿子陈逸和著名术士襄楷来到王芬府上做客。襄楷有观天测命之能，此番他和陈逸来到冀州就是想要告诉王芬一个好消息：天象显示不利于宦官奸佞，这回他们是要彻底被消灭了！王芬听后大喜过望，当即一马当先表示说道：“如果真是这样，我愿意为天下人驱除他们！”于是王芬联络冀州豪杰，与南阳人许攸、沛国人周旌相互交结谋划，想要上书朝廷说黑山盗贼不断侵扰冀州郡县，借口以攻打黑山贼为名让朝廷同意他们举兵。就在这时宫里传来消息，说灵帝不久便要到北方来巡视他在河间的旧居，王芬等人一拍即合，正好趁灵帝北巡之际起兵武力劫持灵帝，然后强迫灵帝下沼杀死那些宦官和常侍。待大事办完，再废黜这个残害忠良发动党锢之祸的昏庸皇帝，另立合肥侯为新皇帝。
