与此同时，担心卢象昇等部兵力不足的崇祯还下诏调在陕西征剿李自成的总督洪承畴率军入京勤王，陕西巡抚孙传庭为兵部侍郎督援军同行。
卢象昇败没之后，高起潜惊恐失措，竟率军东逃二十余里，结果一头撞进了清军的伏击圈，毫无斗志的明军各部一触即溃，高起潜只身逃逸，就此断送了明军在京畿的最后一支机动力量；而自请督察军情的大学士刘宇亮刚到保定就听闻兵败，仓惶之下退回了晋州，而清军则乘胜**，分陷昌平、宝坻、平谷等地，至此京师震动。
崇祯十一年十二月二十日，深觉局势不妙的崇祯皇帝下诏徵洪承畴率军入卫，又命陕西巡抚孙传庭为兵部郎督侍援军同行。
说实在的，洪承畴和孙传庭其实是不愿意率部北上的，这是因为崇祯十年八月以上，明军剿灭流寇的军事行动非常的顺利，其中李自成部在崇祯十年十月于渭南大败后，只剩下18骑退入川、陕、楚交界处，一时间再无声响；
闯塌天（刘国能）部于崇祯十一年正月初四于随州向新任南畿、河南、山西、山西、湖广、四川军务总理熊文灿投降；
马士秀、杜应金部于崇祯十一年二月十二日于信阳城下向明军投降----该部同年十二月于许州重新反明，但于崇祯十二年二月再度降明；
崇祯十一年春季，张献忠于南阳降明；
崇祯十一年九月曹操罗汝才率小秦王白贵、过天星惠登相、整世王王国宁、托天王常国安、十反王杨有贤、花关索王光恩、整十万黑云祥、混世王武自强等通过武当山太和宫太监李继政，向熊文灿投降；
而就在接到崇祯皇帝命令时，左良玉部还在南阳地区逼降了射塌天李万庆、混十万马进忠两部。
因此，眼见得陕西流寇已经彻底失败，河南、湖广、江北一带的流寇也只剩下了老回回、革里眼等少数几部，洪承畴又怎么舍得将到手的大功拱手让出去呢？
但眼下华北的局势又岂是洪承畴和孙传庭不愿意就可以北上的，这不，济南告急了。
其实，清军早在十月初就南下山东了，但当时、兼任兵部尚书的杨嗣昌判断德州才是清军南下的必经之地，所以再三传令山东巡抚颜继祖率兵谨守，却没想到造成了济南城防的严重空虚----整个济南城就只剩下乡兵和莱州援兵1200人守城----因此，当清军得到了事先派遣的间谍的报告，绕开了城防坚固、兵力充足的德州，经临清一线渡过会通河，直插济南城下时，明廷上上下下都傻眼了。
只是，崇祯皇帝和杨嗣昌等人还抱有幻想，认为济南城池高耸，不是匆匆南下的清军所能轻易攻克的。
没错，城内明军和百姓的确拒城死战了60余天，但各路援军却迟迟不至----清军也有打援的意图，所以才让济南城坚持了那么久----因此，守到崇祯十二年正月初二，济南城终于守不住了。
城破之后，王府在济南的德王朱由枢（1642年，死于塞外）、郡王朱慈煩、奉国将军朱恩赏等都被清军掠走，山东左布政使张秉文、右布政使邓谦济、按察使周之训、济州知府苟好善以下近13万济南百姓被清军屠戮一空（另有说法是一百万济南百姓被杀），现场实在是惨不堪言。
可清军并没有因为攻克济南就罢手了，很快，清军又转攻山东其他州县，直至兖州一线，距离徐州也只有百余里之地，这就让淮安、归德、凤阳等地官民大骇，百姓纷纷扶老携幼南渡黄河逃难。
在此情况下，无计可施的崇祯皇帝只能再三催促洪承畴、孙传庭率部北援，于是，在明廷的压力下，功败垂成的洪承畴只好带着秦军等部北上救援。
得知能征善战的明军剿匪部队出击了的清军，遂押解着山东俘获的百姓和财物，退往了天津附近，最后于三月初九，自丰润到冷口，从青山口出塞，退回辽东。
