1898年5月1日的马尼拉湾海战，明军10艘战舰被击中15次（包括几次被诺登飞命中），一共只有一名海军少尉受伤（被弹片切掉一根半手指），其余没有损失。
西班牙亚洲分舰队有7艘战舰被击沉，2艘小型巡洋舰和停在港内的1艘大型运输船被明军俘虏。
399人阵亡，208人被俘或投降。
轻易干掉敌舰队之后，邱宝仁炮击马尼拉湾各处炮台足足四个小时，一直打到夜间，然后派遣陆战队逐一占领那些只有旧式火炮的炮台。
第二天，打着义和拳旗号的华人军武装到来，接管了岸防炮台。
由于殖民者特有的傲慢心里，西班牙人失去了他们的舰队，而且又给自己制造了一个强大的敌人。
五月二日下午，西班牙总督派人来与邱宝仁谈判，这一次他倒是一改以往狂妄的态度，以失败者的身份表示愿意交出马尼拉——因为西班牙人担心明军舰队和义和拳占据的炮台轰击马尼拉市区。
西班牙人的投降条件是要求明军保证马尼拉所有白人的安全，而且要求不得让任何一个有武装的土人进入马尼拉。
明军本来就不是来帮吕宋人的，不可能容忍土人武装进入马尼拉，所以邱宝仁对这个条件一口答应下来。
随后西班牙人又提出一个令人摸不着头脑的要求——他们要求明军进攻马尼拉一次，但不要真的打，只要做个样子就行了。
按照西班牙人的说法，这是为了证明他们不是不战而降，而是进行了“英勇”的抵抗之后，光荣投降……
邱宝仁无法理解这种心里，不过他还是同意了。
五月三日清晨，明军350人的陆战队和4200人的义和拳发动对马尼拉的进攻，明军与西班牙人枪炮齐鸣，互相射击了一个多小时，没有造成任何伤亡。
10点整，西班牙军队降旗投降，随即义和拳进入马尼拉。
