后来的事实证明，华人军谁都不想帮，他们是想独占吕宋。
不过在此之前，一些必要的战略欺骗还是得有的。
对吕宋军方面，华人军表示自己也是受到殖民者压迫的受害者，因而天生同情吕宋人，华人军愿意帮助吕宋人一起打击万恶的殖民者。
但对西班牙人，华人军又是另一套说辞——我们都是文明人，虽然之前确实有仇，但我们跟土人也是有仇的。
若是土人攻陷马尼拉，毫无疑问所有吕宋的白人都会陷入万劫不复的地狱，所以你们不如把马尼拉交给我们，我们背后是伟大的大明帝国，足以保证马尼拉不会陷入野蛮人手中。
然而这个时候，西班牙人仍然抱着不切实际的殖民地老爷风范，他们不仅傲慢的拒绝了华人军的提议，甚至还把邱宝仁的最后通牒也一并退回。
这给了邱宝仁一个完美的借口，5月1日下午14点10分，退回最后通牒的小艇带着15点开战的消息刚刚返航，邱宝仁立刻命令舰队生火备战。
而西班牙舰队也意识到情况不妙，各自生火拔锚，准备迎战。
然而此时已在港内停泊数天的明军早就把西班牙人全都看住了，他们甚至没有规避的空间。
15时整，邱宝仁下令开火。
明军在1500米左右的距离上，向西班牙舰队射击，强大的速射炮火力劈头盖脸的向西班牙人压过去，换装不久的苦味酸榴弹给予无装甲的西班牙战舰可怖的杀伤，战斗一开始就呈现一面倒的状况。
二十分钟之内，西班牙舰队的无防护巡洋舰“维拉斯科”号，“唐·璜·德·奥地利”号，“唐·安东尼奥·德乌格亚”号三艘小型铁肋木壳巡洋舰被击沉。
旗舰“蕾娜·克里斯蒂娜”号和巡洋舰“卡斯蒂利亚”号重创起火，舰员伤亡惨重，不得不抢滩搁浅。
然而抢滩也不是说就能得救，明军的炮弹还在不断落下，火焰四处乱窜，浓烟弥漫，在西班牙水兵试图弃舰逃生的时候，大火烧到“蕾娜·克里斯蒂娜”号的弹药舱，随着一声巨响，这艘铁壳巡洋舰彻底消失。
“卡斯蒂利亚”号的情况稍微好一些，这艘船被打得大量进水，很快淹没了弹药舱，这反而救了很多人的命。
最终“卡斯蒂利亚”号烧了整整6个小时，所有露在水面上的船体和上层建筑物全都被彻底焚毁。
刚一开战，西班牙人就损失了5艘军舰，剩余的两艘小型巡洋舰和两艘炮舰面对明军强大的火力，完全不敢应战，趁着邱宝仁处决五艘巡洋舰的机会，直接离开锚地，向马尼拉湾外驶去。
人头狗邱宝仁第一次没有去追击敌舰，而是转移火力，与马尼拉湾防御炮台展开对射。
然而即使如此，四艘西班牙战舰也没能逃出生天——马尼拉港外还有明军南洋舰队的四艘侦查舰呢。
南甲级四舰即使在南洋舰队中也不算什么了不起的主力，但面对四艘全无战心的西班牙战舰却是足够了。
只有10节航速的炮舰“杜阿罗侯爵”号成了南甲级侦查舰的第一个刀下之鬼，这艘在19世纪最后几年还装着前膛炮的可怜战舰被吨位几乎是其两倍，航速20节，且一侧有两门120速射炮的“南丁”号侦查舰追着打了2个多小时，最终翻沉在南海温暖的海水里。
而炮舰“莱索将军”号的抵抗则更成功一些，其诺登飞速射炮和120架退炮两次逼退试图迫近射击的“南乙”号，不过不到10节的航速根本无法让其逃离。
最终，“莱索将军”号的鱼雷发射管被“南乙”号的速射炮扫中，一枚鱼雷被引爆，这艘520吨的炮舰当场被炸成两节。
“古巴岛”号和“吕宋岛”号原本应该是有机会逃离的。
这两艘舰的航速比南甲级慢不少，但火力上有反抗的余地——6门120架退炮对南甲级的3门120速射炮，但是西班牙人的士气早就已经崩溃了，两艘小型防护巡洋舰与明军“南甲”、“南丙”之间交火不到20分钟，“古巴岛”被命中2炮，“吕宋岛”被命中1次之后，这两舰直接挂起白旗向明军投降，结束了这场一边倒的海战。
