1894年6月17日，北洋宣抚舰队加速返回刘公岛，与刘公岛驻留舰队、旅顺驻留舰队会师。
至此，除了两艘二等炮舰以外，北洋舰队全军到齐。
同一天，北洋舰队总司令刘步蟾海军中将下令，舰队进入战时编组如下：
第一支队：
第一小队：“龙威”（舰队总旗舰，10500吨）、“定远”（7500吨）
第二小队：“凤翔”（舰队预备旗舰，10500吨）、“镇远”（7500吨）
第二支队：
第三小队：“致远”（支队旗舰，2350吨）、“经远”（2900吨）
第四小队：“靖远”（支队预备旗舰，2350吨）、“来远”（2900吨）
第五小队：“济远”（2400吨）、“沧远”（2400吨）
第一强击侦查支队：
第一小队：“扬远”（支队旗舰，4300吨）、“超远”（4600吨）
第二小队：“威远”（支队预备旗舰，4300吨）、“勇远”（4600吨）
第三小队：“恒远”（3900吨）、“兴远”（3900吨）
第一鱼雷艇支队：
左队一至左队十二（95吨级）
第二鱼雷艇支队：
右队一至右队十二（55吨级）
合计战舰16艘，69100吨，另有鱼雷艇24艘。
北洋舰队打破了和平时期同级姐妹舰组成小队的管理，把龙威级和定远级，致远级和经远级，扬远级与超远级混合编组，以期发挥各自强项，小队内互相支援。
与此同时，南洋舰队也在迅速整军北上，按照海军部的统筹安排，南洋舰队战时编组如下：
第三支队：
第六小队：“大捷”（舰队旗舰，6800吨）
第七小队：“龙骧”（舰队预备旗舰，2200吨）、“虎威”（2200吨）
第八小队：“寰泰”（2200吨）、“保民”（2200吨）
第四支队：
第九小队：“开济”（支队旗舰，2200吨）、“镜明”（2200吨）
第十小队：“南瑞”（支队预备旗舰，2200吨）、“南琛”（2200吨）
第十一小队：“福靖”（1350吨）、“福宁”（1350吨）
第二强击侦查支队：
第四小队：“南甲”（支队旗舰，1000吨）、“南乙”（1000吨）
第五小队：“广丙”（支队预备旗舰，1000吨）、“广丁”（1000吨）
第三鱼雷艇支队：
南龙级六艘（110吨级）
第四鱼雷艇支队：
雷一至雷十二（55吨级）
合计战舰15艘，31100吨，另有鱼雷艇18艘。
各舰队大小炮舰炮艇暂且没有参战计划，各自留在驻地港口，负责主力舰队离开后的警备工作。
最为对比，日本联合舰队司令长官伊东佑亨也把手下舰队进行重组，以“松岛”、“严岛”、“桥立”、“千代田”、“比叡”、“扶桑”六舰为本队。
以“八重山”、炮舰“磐城”（720吨）、无防护巡洋舰“天城”（930吨）、炮舰“赤城”（620吨）以及辅助巡洋舰“西京丸”（2700吨）为本队附属附属部队。
