第三，统一大学招生制度和学生学籍管理制度。1938年和1939年，教育部分别制订并公布了《国立各院校统一招生办法大纲》和《公立各院校统一招生委员会章程》。规定：由教育部设立统一的招生委员会，进行统一报考，录取后统一分到各学校，考试科目、命题与评分标准、录取标准，一律由统一的招生委员会规定；全国分15个招生区进行招生；学生入学考试分笔试和口试，笔试分三种科目进行，其中公民、国文、英文（或德文）、本国史地四门为公共必试科目。1941年后停止全国统一招生。1940年5月，教育部制订《专科以上学校学生学业成绩考核办法》，严格成绩考核和升留级制度。1941年11月又发布《专科以上学校学籍管理规则》128条，将学生成绩分为操行成绩和学业成绩两项，操行成绩不及格者不予毕业。
抗日战争时期的高等教育，在极其困难的条件下，有了较大发展。与战前相比，不仅在数量上有了较大发展，而且在教学质量上有了明显提高。到1945年，专科以上学校已发展到141所，学生发展到83498人。
（五）国民党加强对教育的政治思想控制
国民党为了强化其对高校的统治，也采取了一系列措施。
第一，对学校的行政体制作了改革，规定学校行政领导人必须参加国民党，从而确立了国民党对各高校的领导，实现了“以党治校”。从1938年起，各高校设立国民党区党部和三青团分团部，1939年起各校设立训导处。教育部规定：国民党区党部协助学校行政，三青团分团部协助学校训育，训导处执行区党部和三青团委托的事项，区党部书记可以列席校务会议。这样，从学校行政、党、团与训育处四方面加强了国民党对高校的控制。
第二，推行训育制度，加强对学生的思想控制。抗战时期，国民政府先后颁布了《青年训练大纲》、《中等以上学校导师制纲要》和《训育纲要》等，在各校设立训导处推行导师制，监督师生言行，灌输“一个党，一个主义，一个领袖”的法西斯主义，“上应严明以驭下，下应服从以事上”的法西斯准则作为训育目标。1938年10月，教育部向各学校颁布对学生“注重精神训练”的训令，用训练国民党员的《党员十二守则》来要求学生。次年7月，又规定了41条禁令来禁锢学生的思想和言行。
第三，颁布了一整套规章制度，用行政手段强令各校贯彻执行，在学校中建立了训导处、国民党区分党部和三青团三位一体的特务统治，采用威胁、利诱、监视、逮捕、暗杀等手段对付进步师生。广大师生不仅没有言论自由，而且更没有起码的人身保障，因而激起了国统区广大师生的强烈反对，掀起了一次次反独裁争民主的运动。
三、国民政府败亡时期的教育
抗战胜利后，国民政府的教育方针、政策基本上按照抗战前和抗战中的规定执行。
1945年9月，国民政府教育部召开“全国教育善后复员会议”，讨论了关于教育机关的复员和收复区教育复员与整理等问题，并制定了有关具体政策；通过了关于内迁教育机关之复员问题、关于收复区教育复员与整理问题等五大类议案。根据这些议案所决定的原则，国民政府开始对其统治区进行复员、接收和整顿工作。
随后，教育部向各收复区省市派出“教育善后复员特派员”代表教育部在各地行使教育行政领导权，负责指导建立各省市教育厅局机构，对原日伪教育机构与各类学校进行接收和整顿。逮捕了一些日伪时期的教育汉奸，解散日伪建立的各种学校；设立“临时大学补习班”，训练各高校肄业学生；对日伪时代的大中小学教员普遍进行登记、审查和训练，经考核合格者，再决定是否录用；对东北伪满教育，由教育部设立“东北区教育复员辅导委员会”具体办理。
抗战胜利后，各内迁学校纷纷迁回原地复校。到1946年9月大部分学校正式开学复课。一些学校如中央工校、辅成学院、正阳学院、成华大学等，仍留在西南或西北续办；国立中学交各省办理，战区学生遣送回乡。从抗战胜利到国民党结束对大陆的统治，学校教育基本上处于混乱之中。
第一，在初等教育方面，仍然实施国民教育制度，并在全国普遍推行。同时，为了适应新形势的需要，修订了小学课程标准，制订了国民学校及中心国民学校规则，进行小学教员总登记，颁布国民学校教职员任用、待遇、进修保障办法等。1946年1月，教育部又订立了《全国实施国民教育第二次五年计划》。但由于国民党不久便挑起了全面内战，计划多无法实施。
第二，在中等教育方面，中学复员、接收后，学校数量增加，中等教育有了较大的发展。中等职业教育在战后实业建设对初级和中级技术人才需要的刺激下，数量有所增长。但这个发展是极短暂的。1947年开始，随着国民党军事上的失败，一些地区的中学师生受国民党欺骗，纷纷南迁，国民党教育部为安置这些师生，先后设立80多所“临时中学”和“联合中学”。
第三，在高等教育方面，国民政府相继公布了《大学令》、《专科学校法》、《改进师范学院法》，修订《师范学院规程》，制定《国外留学规则》等，加强了对高等教育的控制。1948年1月颁布的《大学法》规定：大学以研究高深学术、养成专门人才为宗旨；大学分国立、省立、市立及私立数种，其设立、变更及停办，均需教育部核准；大学分文、理、法、医、农、工、商等学院；师范学院由国家单独设立，凡具备三学院者，方可称大学。此外，还对学校校长、院长、教师和学生都作了规定。
1948年冬，国民党败局已定，教育行政当局把组织动员大批学校及师生随之迁移、安置逃亡学生作为主要的任务。它先后在平津设立东北临时大学、临时中学，在江南各地设立联合中学及临时中学，诱骗或强制东北和华北地区的青年学生约10万人到这些学校学习。1949年年底，国民党政府在大陆上的教育体系完全崩溃了。
