在推行国民教育制度的同时，原颁布的《小学校法》与国民教育制度发生了矛盾。1944年3月，国民政府公布《国民学校法》，同时废止《小学校法》。规定：（1）确立中心学校名称，改称中心国民学校；（2）保国民学校及乡中心国民学校，不限定设置一校；（3）私人或团体可以设立专办国民学校儿童部之小学；（4）确定国民学校隶属于县政府及院辖市之主管教育行政机构；（5）确定国民学校教员应协助乡镇公所及保办公处，训练民众，推行地方自治；（6）确定学龄儿童及失学民众之强迫入学，另以法律定之。
为推行这种国民教育制度，教育部计划以5年为限，分3期进行。第一期从1940年8月到1942年7月，要求入学儿童达到学龄儿童65％以上，入学民众达到失学民众的30％。第二期从1942年8月到1944年7月，入学儿童达到学龄儿童80％以上，入学民众达到失学民众的50％。第三期从1944年8月到1945年7月，入学儿童达到90％以上，入学民众达到失学民众的60％以上。同时，为了迫使按规定应入学的学龄儿童和失学民众入学，1944年7月，国民政府公布《强迫入学条例》，1945年2月又作了修改，规定：各县、乡成立强迫入学委员会，调查学龄儿童人数，通过劝告、警告、罚款等方式强迫学龄儿童限期入学。
国民教育制度的推行，取得了一定的成效。据1946年年底实施此制度的19个省市的统计：共计315780保，设国民学校及中心国民学校与其他小学237000所，平均每4保设立3校；共有学龄儿童38173765人，已受教育的有29160803人，占学龄儿童总数的76％；文盲总数为92890227人，历年共扫盲53163077人，占文盲总数的57％。
（四）高等教育的恢复和发展
抗战初期，高等教育遭受了严重的摧残。1936年有专科以上学校108所，1937年则降为91所，学生由1936年的41922人，降为1937年的31188人。1938年以后，国民政府努力进行恢复工作，采取了不少措施。
第一，统一师范学院的设置和要求。1938年7月，教育部公布《师范学院规程》，1942年8月，又公布《修正师范学院规程》，对师范学院的设立、培养目标、组织及课程、学生待遇及毕业服务等问题都作了具体的规定。（1）师范学院以养成中等学校之健全师资为目的；（2）师范学院单独设立；（3）师范学院修业期为5年，专科为3年；（4）可设师范研究所、中小学教师进修班，并设立国文、外国语、史地、公民训育、算学、理化等专修科；（5）学生一律住校，免缴学、膳费；（6）课程分普通基本科目、教育基本科目、分系专门科目和专业训练科目。从1938年度起，中央大学、西南联大、中山大学及浙江大学分别设立了师范学院，并在湖南蓝田设立了第一所独立师范学院。到1945年，在国统区共设立了6所独立的师范学院；5所附设于大学的师范学院，共有学生9026人。
第二，统一高校行政机构及其职责，统一大学课程设置标准。1939年5月，教育部公布了《大学行政组织补充要点》、《独立学院及专科学校行政组织补充要点》，对大学、独立学院及专科学校的行政组织机构的设置名称、人员配备、职权范围与工作方式都作了统一规定。1938年，教育部整理大学课程，拟定了《文、理、法三学院各学系课程整理办法草案》，同年9月，又召开第一次全国课程会议，拟定了《文、理、法三学院共同科目表》，并予以公布，对各高校课程设置，作了原则性规定。1940年10月，教育部公布了《大学及独立学院教员资格审查暂行规程》，对大学助教、讲师、副教授、教授的资格作了明确规定。
