陆修静作为南朝道教的一代宗师，他融合天师道与神仙道教，经过清理整顿，终于使早期民间道教完成了向官方道教的转变。首先，陆修静对道教组织进行了整顿改造。早期五斗米道的组织主要模仿封建国家地方管理组织，其基本特征是“立治置治”。即由兼具道师和官吏双重身份的道官祭酒承担管理道民的职责，实行政教合一的统治。并相应地建立有三会制度、宅录制度、缴纳命信制度等一套管理制度，来维持道师对道民的统摄。如规定道民在三会之日必须到本师治所去参加宗教活动，听道师宣布科禁，考校功过。随着民间道教在向官方道教转化过程中出现的分化，原先的这套制度名存实亡，一些道徒越过本师，另投他师；一些道民不赴师治参加活动，不交租米命信；一些道官自署治职，自坏科禁。说明早期民间道教的那套组织形式已经不能适应道教发展的需要了。与此同时，源于神仙道教的道馆开始出现，成为出家道士集体生活、进行宗教活动的场所。在道馆中，道士之间虽也有等级区分，但相互之间是宗教关系；道民也无须再交纳租米，道馆除了能得帝室官府和信徒的赏赐、施舍外，还有自己的地产房舍。陆修静在庐山建造的简寂馆，有众多门徒修行，已具后世道观的规模。宋明帝为陆修静在京城建造的崇虚馆，更是最早的政府为道士修建的道馆。道馆代替民间道教早期的道治、静室，并不仅仅是名称的改变，而是从形式到内容都使得道教组织发生了变化，成为与佛教寺院相类似的宗教组织。隋唐以后，道馆改称观，大者称为宫，宫观制度一直沿袭到近代。
其次，对道教经典进行了整理。东晋中后期，大批道教新经典的制作，丰富了道教的教义，但同时也出现了滥造现象。使得这些新经典之间互无统属，甚至相互矛盾的混乱状况，不利于道教的发展。为此，陆修静广泛收集各种道经，经过30多年的努力，考证源流，辨别真伪，分门别类，完成了道教经典的整理工作。将道书分成三洞（洞真、洞玄、洞神）、四辅（太玄、太干、太清、正一），其中三洞经典是道教的主经，分为十二类。三洞四辅十二类不仅仅是道书的分类，也是道经品级高低的区分标准和道士的阶级次序排列。修持不同经法的道士有不同称号，修行得道的品位也有所不同。上清经最高，正一法箓最低，因此修上清者能成“圣”，而修太清则仅能成仙。学道者必须由低到高，依次逐级修持经法，不得超越。陆修静首创的三洞四辅十二类体系，经过南北朝诸多道士的不断补充完善，成为中国道教史中道经整理的标准，此后，历代整理道书，编修《道藏》，均根据这一体系。
最后，建立完善道教斋醮仪轨。早期民间道教虽已有一些道诫，但很不完善，陆修静在吸取佛教戒律的基础上，根据道教的特点，制定了一套更为完整成熟的道教仪轨，即九等斋十二法的斋醮体系。这一套斋法，与他对道经的分类相一致，上清斋法为高品，天师道的旧斋法为下品，并对施行斋法时的具体仪式作了详细说明。道士在日常修行，或为人祈福禳灾、治病救度、超拔亡灵时都要遵守斋法规定的程序。为了强调斋法的重要性，陆修静一方面身体力行，亲率道士进行斋法实践；另一方面，对斋仪的重要性进行理论解释，把斋法作为求道之本。从而使得道教斋法不仅有了系统的仪式规范，而且在理论上也日渐成熟。
南朝时期，道教在从早期民间道教走向更加完备成熟的官方道教的过程中，陆修静的上述努力起了一个积极的推动作用。当然，新的官方道教的创立，有一个过程，非陆修静一人之力，其前有葛洪等人的开路，其后有陶弘景等人的继续。
南朝道教改革的另一著名人物是陶弘景。陶弘景为陆修静的再传弟子，作为南朝道教改革的集大成者，为道教上清派的形成做出了巨大贡献。他自永明年间服膺道教后，广泛搜寻道经，对上清经法进行整理、弘扬，先后撰写了《真诰》《登真隐诀》等重要著作。
