魏晋南北朝时期，随着宗教的迅速发展，反对宗教有神论的斗争也随之发展，无神论者与有神论者展开了激烈的争论。争论的对象以佛教为主，争论的焦点则集中在神灭与神不灭这一核心问题。神不灭论是佛教宣扬的因果报应和轮回说赖以存在的基础，神灭论则是无神论者反对佛教及鬼神迷信的依据。从魏晋到南北朝，这一争论一直没有停止过，其激烈程度不亚于佛道之争，而其积极意义则远胜于佛道之争。
一、魏晋时期的无神论与有神论之争
魏晋时期，在佛、道二教伴随着尖锐的社会矛盾而发展起来的同时，一批具有无神论思想的知识分子也纷纷撰文著论，与有神论者展开辩论。其中著名的有曹植、阮瞻、阮修、孙盛、戴逵等。
曹植，字子建，曹操之子，长于诗文，曾著《辨道论》，对道教神仙方术进行了尖锐的批判。其观点主要有二：
（一）人之生死是自然之理，成仙之说是欺众惑民
曹植认为，人的身体强弱，寿命长短，因人而异。善于保养者身体强健，寿命较长；辛劳过度者则身体虚弱，寿命就短。但不论寿命长短，人必有一死，这是客观规律。而道教方士所说服药炼丹，长生不死纯是**百姓的虚妄之言。他曾与方士当面辩论。一位方士吹嘘说，取两条活鲤鱼，一条涂上药，另一条不涂，同时放入沸水之中，有药者奋尾鼓鳃，沉浮游动，就像在水中一样，而另一条则一下就煮熟了，以此说明服药之灵验。曹植要方士当场试验，方士不敢，搪塞一番，骗局被揭穿。曹植还指出，欲成仙者其实都无好结果，秦始皇死于沙丘，汉武帝崩于五柞。怂恿成仙的方士也都落了个诛其身、灭其族的下场。可见，方士道徒实为骗子，成仙长生从无实证。
（二）灾异发生与鬼神无关
自然界发生的灾害、社会流行的疾疫，都不是鬼神所作。自然界的灾害，是气候变化；疫病流行一是由自然气候变异，二是生活条件恶劣所致。如疾疫流行感染上的人，都是生活贫困者，公卿贵族，达官显贵就极少有染上者，为什么？生活条件的优劣所决定。而且，疾疫流行还往往与吏治清明与否，社会是否稳定等有关。道教方士所说的求神禳灾、符水治病毫无意义。
阮瞻、阮修均为西晋著名的玄学之士。阮瞻性情超然，清虚寡欲，儒家学说及老庄之道兼通，妙解音律。他素不信鬼，与人相辩，从未被难倒过。传说他曾与鬼辩论，一天，有客来拜访阮瞻，问候之后，便谈名理。来客甚有才辩，谈到鬼神之事时，反复辩难，来客终于理屈，乃变脸色说：古今圣贤皆敬事鬼神，你为什么偏偏就说没有鬼，我就是鬼。于是变为异形消失。从这则传说中可以看出，阮瞻的无鬼论思想十分坚定，理由充足，无人能驳倒他。阮修也是一个无鬼论者，《晋书·阮修传》记载：“尝有论鬼神有无者，皆以人死者有鬼，修独以为无。”阮修反驳有鬼论者的说法时用了一个例子：凡是说见过鬼的人都说鬼穿着生前的衣服，如果说人死后变鬼，那么，衣服有没有鬼呢？可见世上并无鬼。
