1946年6月，部分军统部门并入国防部二厅，二厅亦负责部分情报安全工作。
二、军统
军统局是“国民政府军事委员会调查统计局”（bis）的简称，是1938－1950年成立之中华民国情报机关之一，早期的领导人为戴笠，1946年，由毛人凤继任。
特工人员最多时近5万名，分布到中国国民党的军队、警察、行政机关、交通运输机构，乃至驻外使领馆，专门以监视、绑架、逮捕和暗杀等手段进行活动。军统局在许多地方设有集中营、秘密监狱和看守所，囚禁中国gcd。
抗日战争期间，军统也从事一些搜集敌方情报并恐怖活动。也有一些军统人员投降日本，日本占领区的重要特务头子不少来自军统.
1949年，军统主要机构撤至台湾。中华人民共和国中央人民政府对留在大陆的军统严厉镇压，到五十年代中，军统在大陆大致肃清。
建立之初
一九三一年“九一八”事变后，国民政府和蒋介石为了进一步加强中央政府的集权，以加强国家统一，为日后全面抗战做准备，效仿墨索里尼的“黑衫党”，在黄埔军人贺衷寒、戴笠、郑介民、康泽等“十三太保”的策划下，组织了一个以军人为主体的复兴社(有人称兰衣社)，1932年又在复兴社内设核心组织力行社。
力行社，设有一个专门进行谍报活动的特务处，它是军统局的最前身。戴笠为处长。
一九三七年底，力行社特务处，与特工总部（1927年成立之“国民政府军事委员会密查组”）合并，成立‘’国民政府军事委员会调查统计局‘’。下辖二处，第一处负责党务，第二处则负责情报，并直接向委员长蒋中正负责。力行社特务处编为该局第二处。
前期
事务
抗战开始的1938年8月，该局重组，第一处另成为“国民党中央执行委员会调查统计局”(即中统)，而军统局仍交由戴笠负责。除负责刺探情报，进行反谍工作外，军统局亦以刺杀等手段执行情报任务，反对中国gcd。抗战期间军统局曾多次刺杀投日的军政人员，如暗杀张啸林、唐经，暗杀未成的有殷汝耕、季云卿、汪精卫、周佛海。而隶属bis的各个“游击司令部”和“交通警察大队”则深入日寇占领区开展广泛的游击战，对打击日寇和汉奸，起了不小的作用。国民党两大特务组织之一”军统”成立1938年8月，国民政府军事委员会调查统计局成立，简称”军统”它是国民党两个主要特务组织之一。其前身是复兴社的核心组织”力行社”的特务处。军统局内勤组织共有八处、六室、一所;外勤组织在各大城市设”区”在各省设”站”，在一些重要城市设特别组，它甚至连边远如伊犁、拉萨及一些国外的重要城市都设有机构。”军统”的基本组织是”组”及直属情报员，它们的特工人员分布到国民党的军队、警察、行政机关以及交通运输等各个部门。它控制了一些大专院校的”抗日锄奸团”、海关、边卡和交通要道的”缉私大队”、”税警大队”、”盐警大队”、铁路沿线的”交通大队”，以及江南各沦陷区的”忠义救**”等公开武装部队。军统利用监视、绑架、逮捕和暗杀等手段，进行特务活动。抗战期间，军统局的正式在册人员和学员，在抗日战争中牺牲者就达18000人以上，而抗战结束时全部注册人员为4万5千余。其他附属人员牺牲者更众。
同时，军统对gcd进行收集情报和暗杀，如1940年8月13日，中国gcd陈昭礼少将（全国战地动员委员会委员）在崇安吴公岭被事先埋伏的务军统杀害。也有一些军统人员投降日本，日本占领区的重要特务头子大多来自军统中统，如李士群、丁默村等。
组织形式
军统局的组织形式是局-区-站-组-队，有的地方设有相当区、站的办事处。组是军统局特工组织的基本单位。由于任务不同，组又分普通组、潜伏组、行动组、策反组、随军组、防谍组、组等。每组通常由十人左右组成。
