1939年 五十岁 英国牛津大学聘先生为汉学教授，并授予皇家学会研究员职称。因欧战爆发，候船时滞留香港。《隋唐制度渊源略论稿》始写于本年。
1940年 五十一岁 仍任教西南联大。讲授“隋唐史研究”“白居易研究”。三月，赴重庆参加中央研究院第五届评议会。作于此时的《庚辰暮春重庆夜归作》有句：“食蛤那知天下事，看花愁近最高楼。”暑期后又至港，再候赴英国飞机，仍未成行。八月起，就任香港大学客座教授。
1941年 五十二岁 《唐代政治史述论稿》成书。十二月八日，太平洋战争爆发，辞去港大职务，困居香港。
1942年 五十三岁 离港赴桂林，任教广西大学。《杨树达积微居小学金石论丛续稿序》作于本年。
1943年 五十四岁 十二月，由桂林抵成都，任教燕京大学。开始《元白诗笺证稿》的写作。
1945年 五十六岁 八月十日，日本投降。先生《乙酉八月十一日晨起闻日本乞降喜赋》云：“降书夕到醒方知，何幸今生见此时。闻讯杜陵欢至泣，还家贺监病弥衰。国仇已雪南迁耻，家祭难忘北定诗。念往忧来无限感，喜心题句又成悲。”秋间，应英国皇家学会之约，赴伦敦治疗眼疾。
1946年 五十七岁 清华复校，先生返回任教。后名其书斋为“不见为静之室”。
1949年 六十岁 在岭南大学，任中文历史两系教授。《崔浩与寇谦之》写于本年。本年暑假起，程曦开始担任先生助教，两年后程离开，由陈夫人自任助手。
1950年 六十一岁 《元白诗笺证稿》整理完成，岭南大学作为本校文化研究室丛书之一，线装印行。
1951年 六十二岁 专任岭南大学历史系教授。《论韩愈》竣稿。《论唐高祖称臣于突厥事》写于本年。
1952年 六十三岁 院系调整后岭南大学取消。先生改任中山大学历史系教授。本年冬开始，助手由黄萱女士担任，直至一九六六年被迫离开。
1954年 六十五岁 春天，国务院派汪篯（曾做过先生助手）到广州，迎请先生任中国科学院历史第二所所长，不就。《论再生缘》竣稿。开始撰写《钱柳因缘诗释证稿》。
1956年 六十七岁 春初，陈毅副总理携夫人张茜访先生于中山大学，谈及《世说新语》。本年陶铸出任中南局首脑，看望过先生。
1958年 六十九岁 报刊公开发表文章批判先生学术思想。本年始不再讲课。尝谓：“是他们不要我的东西，不是我不教的。”
1961年 七十二岁 八月三十日，吴宓自重庆来广州探望先生，九月四日离去。《雨僧日记》一九六一年八月三十日写道：“寅恪兄之思想及主张，毫未改变，即仍遵守昔年‘中学为体，西学为用’之说（中国文化本位论）……但在我辈个人如寅恪者，则仍确信中国孔子儒道之正大，有裨于全世界，而佛教亦纯正。我辈本此信仰，故虽危行言殆，但屹立不动，决不从时俗为转移。”
1962年 七十三岁 春天，陶铸陪同胡乔木看望先生，谈起著作出版事，先生说：“盖棺有期，出版无日。”胡乔木说：“出版有期，盖棺尚远。”七月，入浴时跌倒，右腿骨折断。
1964年 七十五岁 《钱柳因缘诗释证稿》完成，后改名为《柳如是别传》。全书八十万言，全部由先生口授，黄萱笔录。《稿竟说偈》云：“奇女气销，三百载下。孰发幽光，陈最良也。嗟陈教授，越教越哑。丽香闹学，皋比决舍。无事转忙，然脂暝写。成卌万言，如瓶水泻。怒骂嬉笑，亦俚亦雅。非旧非新，童牛角马。刻意伤春，贮泪盈把。痛哭古人，留赠来者。”
1966年 七十七岁 《寒柳堂记梦未定稿》写成。对黄萱说：“此书将来作为我的自撰年谱。”“文革”起，先生遭围攻，多次被抄家，心脏病日渐恶化。
1968年 七十九岁 对黄萱说：“我的研究方法，是你最熟识的。我死之后，你可为我写篇谈谈我是如何做科学研究的文章。”黄萱回答：“陈先生，真对不起，您的东西我实在没学到手。”先生说：“没有学到，那就好了，免得中我的毒。”
1969年 八十岁 十月七日，晨五时半，先生逝世。十一月二十一日，陈夫人唐晓莹亦逝，终年七十二岁。前此先生有预《挽晓莹》一联：涕泣对牛衣，卌载都成断肠史；废残难豹隐，九泉稍待眼枯人。
