康熙一方面在表面上麻痹鳌拜，一方面选择一群身强力壮的少年练习扑击之术。1669年5月，康熙决定采取行动。他首先将鳌拜的党羽以各种名义派出，削弱鳌拜的势力，然后派人将鳌拜召入宫中擒获。鳌拜的党羽在此之后也被一一擒拿。
他下诏说：“鳌拜愚悖无知，诚合夷族。特念效力年久，迭立战功，贷其死，籍贯没拘禁。” 也就是说，鳌拜因立过许多战功，所以免于一死而终身监禁。对于其党羽也给予了不同的处罚。同时恢复了苏克萨哈的职位。这种措施稳定了满清的朝局。康熙翦除鳌拜后，废除了辅政体制，收回了朱批大权。自此才真正开始了亲政。
在政治上，康熙进一步加强了皇权。他表示“天下大权当统于一”，“天下大小事务，皆朕一身亲理，无可旁贷。若将要务分任于人，则断不可行”（《清圣祖实录》卷284，康熙五十八年四月辛亥）。为此，他一方面通过各种手段，采取强有力的措施，限制满洲贵族的权力，如剥夺各旗王公干预旗务的权力，破除“军功勋旧诸王”统兵征伐的传统，削弱议政王大臣会议的政治影响等。另一方面，康熙将用人之权、奖惩之权亲自控制，不许大臣干预；并设立密奏制度，以广泛体察下情。这种统治方式为被雍正、乾隆二帝继承和发展，并为清朝其他皇帝沿用。
康熙还是位多才多艺的学者。钱宗范在《康熙》中说：“他一生勤奋好学，博览群书。自然科学方面的数学、天文、历法、物理、地理、农学、医学、工程技术；人文方面的经、史、子、集；艺术方面的声律、书法、诗画。他几乎都有所研究。他写出了八九十篇关于自然科学方面的论著，他亲自审定了多种历史方面的书籍，他还精通多种民族语言。”
康熙善射。他晚年对近御侍卫说：“我自幼至老，用鸟枪弓箭射死老虎135只，熊20只，豹25只，猞狲10只，麋鹿14只，狼132只，吹哨引来而射死的鹿几百只。射获其余野兽不计其数。曾一天之内射兔318只。”
康熙有丰富的水利知识。他六巡江南视察河工，对每项水利工程都能作出具体指示。他最后一次南巡（康熙四十六年一至三月）是亲自考察泗州西溜淮套是否可以开河才去的。经过实地考察，他正确地予以否决。
康熙是清朝历史上在位时间最长的皇帝。他文武双全，既精通传统文化，又涉猎西方科学；既能上马开弓，御驾亲征击退噶尔丹，又能治国安邦管理天下。他运筹帷幄，坐镇北京取得了平三藩、遏沙俄的胜利，还收复台湾，显示了康熙卓越的军事指挥才能。另一方面，康熙有着过人的政治眼光和手腕。康熙创立“多伦会盟”取代战争，联络蒙古各部；以条约确保了黑龙江的领土不被侵犯。卓越的功绩，为持续100多年的“康雍乾盛世”奠定了良好的基础。
大事件
吐尔扈特东归
吐尔扈特蒙古部是我国西蒙古卫拉特四部之一。四部卫拉特分为：准噶尔、和硕特、林尔伯特和吐尔扈物四大部落。
公元十七世纪初，准噶尔部势力渐驱强大，意欲兼并土尔扈特部。土尔扈特部不行已从新疆的塔尔巴哈台出发，向西迁徒，他们远离故土，迁到了伏尔加河流域。后来他们就在那里建立了游牧基地，定居下来，历时140余年。
