其次，托马斯·阿奎那对基督教哲学的改造，对欧洲中世纪的教学内容产生了较大的影响。欧洲传统教育的教学内容一般都比较注重神学的至尊地位，托马斯·阿奎那也把神学放在重要的位置上。他在论述神学与其他学科的关系时指出，神学是关于信仰的学问，是来自上帝的启示，神学的价值超出其他学科的价值。但他的认识又有不同于传统的基督教思想的一面。托马斯·阿奎那认为，尽管神学有最高的价值，但哲学和其他学科也有自身的价值，哲学是由事实来认识上帝，二者是可以共存的。另外，哲学可以用后天的事实来证明上帝的存在。因此，应当重视对不同事物的认识，如事物的运动、事物运动的原因、事物产生的可能性和必然性、不同事物发展的等级性以及世界的秩序等。通过对这些事物的认识，可以说明上帝的存在。因此，在教学内容上，不仅要重视神学，也要重视哲学，重视物理学、数学等。托马斯·阿奎那不仅运用亚里士多德的思想来改造基督教哲学，而且还亲自研究亚氏的著作，写下了大量的评注，为中世纪的教育教学内容提供了丰富的材料。例如，1268—1272年在巴黎大学时，他对亚氏的《物理学》《后分析篇》《解释篇》《政治学》《伦理学》《论感觉》《论记忆》《论灵魂》等做了评注。1272—1274年，托马斯·阿奎那又完成了对《形而上学》《论天》《论生灭》的评注。总之，托马斯·阿奎那的这些工作，调和了基督教学说与亚里士多德学说的矛盾，使得亚氏的学说进入了神学领域，成为基督教精神的新的基础。同时，通过对亚氏学说的介绍和评注，托马斯·阿奎那也使得中世纪的教学内容吸收了世俗科学知识，在一定程度上推进了中世纪教育教学内容的发展。
