总之，在托马斯·阿奎那看来，要想促进基督教事业的发展，就必须借助亚里士多德学说的力量。亚氏关于人的知识基于自然界和有赖于感觉经验，关于人的认识两个阶段的思想，以及关于辩证思维的思想等，超越了当时的以柏拉图思想为基础的奥古斯丁主义，给人们思想带来了较大的震撼和冲击，使得人们不得不承认亚里士多德思想中确实有许多合理性的方面。为此，托马斯·阿奎那大声疾呼，应当头脑清醒地对待过去和现在发生的一切，认真研究亚里士多德的思想，让亚氏的思想为基督教思想服务，成为基督教经院哲学思想的重要组成部分。当然，托马斯·阿奎那在改造基督教经院哲学时，并不是完全否定奥古斯丁主义的全部观点的，而是承认其观点的合理性方面，修正其观点的不适用方面，使其成为基督教经院哲学的有机组成部分。总之，托马斯·阿奎那以亚里士多德的思想为基础，以基督教思想为内核，改造了旧形式的早期的基督教经院哲学，使经院哲学走出了解体的困境。从此，经院哲学开始摆脱以奥古斯丁主义为代表的基督教哲学的思维模式，更加关注神学发展与哲学发展的联系，关注基督教发展与社会现实发展的联系，使基督教的发展更具有灵活性和适应性。
但是，托马斯·阿奎那对经院哲学的改造，并没有统一基督教内部的思想，他的主张在他生前也没有被全体教会所采纳，反而遭到反对派强烈地批评和指责。是拥护还是反对托马斯·阿奎那的思想，在他在世时一直成为基督教内部争论和斗争的焦点。托马斯·阿奎那去世后，这种斗争更为激烈，他的学说一度与阿威罗伊学派一道被看成是异端邪说。1277年，在纪念托马斯·阿奎那逝世3周年的日子里，巴黎大学的神学院教授举行会议，谴责亚里士多德主义，并禁止讲授托马斯·阿奎那的一些观点。1279年，法兰西斯学派的威廉写了《纠正托马斯》一书，对托马斯·阿奎那《神学大全》的许多观点进行了批判。法兰西斯修会还召开大会号召全体成员批判托马斯·阿奎那的思想。与此同时，拥护托马斯·阿奎那的多米尼克修会针锋相对，多次召开大会，宣布托马斯·阿奎那的思想是正确的，主张以托马斯·阿奎那的思想为学术研究的指南。一些教士还著书立说，论证托马斯·阿奎那哲学思想的内在价值，反击反对派的进攻，使得托马斯·阿奎那的思想又引起人们的关注。
基督教的发展总是需要以一定的思想权威为精神支柱的。罗马教廷在权衡利弊后，最后确立了托马斯·阿奎那思想的正统地位。1323年，教皇约翰二十二世册封托马斯·阿奎那为圣徒，肯定“托马斯·阿奎那著作的每一章节都包含无比的力量”，“托马斯·阿奎那的学说是无与伦比的”。托马斯·阿奎那还被授予“天使博士”的称号。14世纪中叶以后，托马斯·阿奎那的思想成为经院哲学的核心，许多大学纷纷以研究和传播托马斯·阿奎那的哲学为荣，使托马斯主义达到了全盛。宗教改革时期，教皇试图通过复兴托马斯·阿奎那的思想权威，以重振基督教事业。16世纪中期，天主教主教会议规定托马斯主义为天主教会正统学说。19世纪后期，教廷为使天主教适应现代社会思潮，再次号召复兴托马斯主义。自此，以托马斯主义为基础的新经院哲学兴起，新托马斯主义成为20世纪西方哲学的重要流派之一。
二、托马斯·阿奎那与中世纪的欧洲教育
托马斯·阿奎那的基督教哲学思想不仅推动了欧洲经院哲学的发展，也在一定程度上影响了欧洲中世纪的教育，使中世纪教育在许多方面都发生了一些重要的变化。
