然而,亚里士多德的思想并不因一些保守派的反对而停止传播,也不因托马斯·阿奎那的一时失败而失去地位。相反,随着亚氏著作的不断翻译和介绍,西欧形成了研究和学习亚里士多德思想的浪潮。在这个浪潮面前,罗马教廷不得不改变策略,于1256年重新让托马斯·阿奎那返回巴黎大学继续主持讲座。托马斯·阿奎那回到巴黎大学后,不仅积极地进行教学活动,而且还开设多种形式的辩论会。在辩论中,托马斯也一改过去的风格,大胆迎接挑战,以其独到的见解,对神学上的任何问题,哪怕是十分复杂和深奥的难题,做到深入浅出的解答。有时,他还举行不限范围、不定题目的随问随答的辩论会,通过辩论和解答别人提出的问题,来阐述自己的观点,扩大自己的影响。作为一名教师,托马斯·阿奎那除了讲课和参加辩论外,还应同事之邀写了两篇文章:《论自然的原则》和《论存在与本质》。这两篇文章分别解释了亚里士多德的形而上学和后亚里士多德的物理学上的一些术语,被认为是托马斯·阿奎那哲学体系早期的重要著作。由于托马斯·阿奎那优异的教育教学成绩,巴黎大学校长于1256年建议授予其博士学位,并破格晋升其为大学教授。1256—1259年,是托马斯·阿奎那在巴黎大学站住阵地,并不断扩大自己影响的时期。在这个时期,他以神学博士这一最高的荣誉资格进行教学,并全力以赴地运用亚里士多德的哲学理论,讲述《圣经》和讨论各种神学问题。他认为神学的中心问题是上帝创造一切,现实的一切变革均以上帝为目的,为宣传上帝服务。为了更好地把基督教神学的学习与社会的现实问题结合起来,托马斯·阿奎那在巴黎第一次主持关于“真理”问题的讨论,它涉及了哲学、神学以及社会现实等12个问题的讨论:上帝、天使和人的真理及对真理的认识,天命和预定,恩典和辩护,理性,良心和自由意志,情绪,狂喜,先知,教育等。在总共29个问题中,每个问题只涉及一个主题,但它本身又由许多个别的题目构成。例如,以真理为主题的问题,就由“什么是真理?”“真理只有一个吗?”“理解会有错误吗?”等12个辩论构成。在教学和辩论的基础上,托马斯·阿奎那写出了《论真理》一书。全书由253个辩论题目组成,字数在50万以上,成为托马斯·阿奎那教学活动的主要成果。在这本书里,他对真理做了三重区分,即真理以不同的方式分别属于实在、感觉和判断,而主要是在个体的判断之中。