1001年，伊本·西那来到花剌子模，在戈尔甘城结识了富商艾布·穆罕默德·希拉兹，由于他的帮助，伊本·西那在这里办了一所学校，收徒讲学，同时开始编写《医典》（TheCanonofMedicine）一书。学生阿布·奥贝德·朱尔加尼就是从这里开始终生追随着他的，最后还为伊本·西那编写了生平传记。我们今天了解这位哲学家、教育家，不少内容就是通过这本传记而获得的。后来，戈尔甘城发生动乱，伊本·西那到了哈马丹（Hamadan），在这里他又为哈马丹的苏丹夏姆斯·道莱治好了顽疾，因其博学和才干被苏丹任命为宰相。伊本·西那执法十分严厉，得罪了军队中的武官，这些人极力排斥他。苏丹被迫将他免职，伊本·西那一度还被囚于监狱，财产被武官们洗劫一空。后来夏姆斯·道莱旧病复发，只好又请回伊本·西那为之治病，苏丹向他道歉，又使他官复原职。这以后他度过了一段较为安定的时间。白天，他协助苏丹治理国事，闲暇时为学生讲学，晚上著书立说。学生们请求他写一本全面反映亚里士多德哲学观的书，于是他开始写《治疗篇》（TheHealing），由学生朱尔加尼负责核对，另一位学生校对《医典》，并将订正和修补意见补入。999年苏丹夏姆斯·道莱在征战中身亡，新君即位，有意对伊本·西那怠慢，于是伊本·西那萌发了离去的念头，他秘密写信给伊斯法罕的苏丹，希望为之效力。事发后他又在狱中度过了4个月。在狱中，他写了第一篇苏非派论文《哈伊·本·耶格赞》（HayyIbnYagzan），还有《治疗篇》的逻辑学部分。后来他设法越狱，乔装后逃到伊斯法罕，在那儿他受到苏丹阿拉渥·道莱的欢迎，并受重用达13年之久。1030年，伊斯法罕城一度失陷，占领军抢劫了伊本·西那的住宅，他写的《公正书》这部大型百科全书全部失落，这部书共20卷，有2800个哲学命题，其中包含被称为“东方哲理”的关于他个人的哲学思想，以后流传下来的只有一些片断章节。1037年，他在陪同阿拉渥·道莱出征哈马丹时，患病不愈，去世后被安葬在哈马丹城郊，终年57岁。
