毕达哥拉斯把物质与精神、肉体与灵魂、上帝与世界分离开的二元论，通过恩培多克勒和柏拉图等人，对后世的思想进程产生了深远影响。同时也正是毕达哥拉斯及其学派对生活实践准则的认真关注，第一次使伦理学和社会理论的问题成为哲学研究的课题，第一次使“人”的问题进入哲学家的视野。
一、毕达哥拉斯教育思想的理论基础
（一）数是万物的本原
在公元前6世纪的希腊哲学家面前，摆着两条道路：一条是理性的思维和探究的道路，伊奥尼亚物理学家遵循了这条道路；另一条是宗教的唯心的神秘主义道路，当时盛行于希腊的奥菲斯教派为希腊人指引了这条道路。从此以后，希腊哲学的整个发展就表现为连续不断的争论，而在一些重要方面又表现出本国的一元论思想与东方的二元论思想，即希腊理性主义与东方神秘主义之间的调和。这两条发展路线并非截然分开，而是交叉的，时而分道扬镳，如在德谟克里特和柏拉图的思想中；时而它们又结合起来形成新的富有成果的思想，在毕达哥拉斯学派那里就是这样。研究希腊哲学的学者都认为，毕达哥拉斯学派是最神秘而难以理清的学派。他们身上引人注目地结合着神秘主义和理性主义的因素，以致后来整个学派本身发生分裂，分作严格坚持宗教戒律忌讳的“信条派”（Acousmatics）与发展理性传统的“数理学派”（Mathematicians）。
在毕达哥拉斯以前的希腊自然哲学家的思想中，自然与精神是不分离的。一切事物都是有生命的，包括石头，都注入了一定精神。因此，在他们那里，并不存在生命和精神的问题。到了毕达哥拉斯，在客观物质世界之先，出现了另一个抽象的世界——数。于是，物质与精神第一次被分离了。
继承伊奥尼亚自然哲学家的传统，毕达哥拉斯探讨了万物的本原问题。他认为：数是万物的本原。据说，有一次毕达哥拉斯经过一家打铁铺，听见打铁铺里传出的打铁声十分和谐悦耳。经过仔细观察后，他回家做了一个琴弦实验，发现如果甲弦负重12磅，乙弦负重6磅，即二者之间的比例是2∶1时，琴弦便发出八音度的谐音来；如果二者之间的比例是12∶8或3∶2时，便发出五音度的谐音来；如果二者之间的比例是12∶9或4∶3时，便发出四音度的谐音来。这是西方有记载的第一次在观察经验基础上进行的科学实验，而毕达哥拉斯可能因此逐步领悟到世间万物皆归于数的原理。正如伯奈特（Burnet）指出的：“有充分理由假定，毕达哥拉斯是这样推论的：要是乐音归结为数，那么其他任何东西为什么不能归结为数呢？”[7]亚里士多德对此过程做了比较系统的概述：“毕达哥拉斯学派孜孜从事数学的研究，并且最先推进了这门学科，进而认识到数的本原就是万物的本原……他们似乎发现了数和存在的生成的事物有较多相似之处，比在火、水、土中能找到更多，如某种数是正义，另一种是灵魂和理性，再有一种是机会，几乎所有一切别的东西无一不可以用数来表述。还有，他们看到音律的特性和比例也是可以用数来表现的。一切其他事物就其整个本性来说都是以数为范型的，数在整个自然中看来是居于第一位的东西，所以他们认为数的元素就是万物的元素，认为整个天就是一个和音，也是数。”[8]
