接下来要介绍的三幅作品原作已被毁，仅存印刷品、复制品。它们是克里姆特受教育部委托，为维也纳大学礼堂创作的壁画组图，分别以哲学、医学和法学为主题，应当表现“光明战胜黑暗”的思想，宣扬科学与理性的重大社会功用。克里姆特创作的三幅画作却激怒了官方和众多教授。壁画《哲学》（1900）4以未完成形式在巴黎世博会上参展并获奖。在这幅画中，一群人体（包括童年、青年和老年）仿佛纠结在一起，悬浮于空****的宇宙中，自上而下缓缓飘移，这一运动既无明确的方向和目标，也缺乏具体的时空界定，人物所共同的是殚精竭虑的痛苦神情；在混沌星空中，画面右边是盲人般沉睡着的斯芬克斯，只有画面下端的女人的脸代表着理性。整幅画并没有彰显哲学作为理性科学对社会产生的指引启蒙作用，没有传达出目标明确的进步历史观，而是呈现出循环往复的自然进程。这一进程是理性不能洞察，认识无法干预的。因此，这幅画作一定程度上颠覆了人驾驭自然的乐观进步信念。
4 克里姆特，壁画《哲学》，1900
维也纳大学哲学系87名教授联名反对这幅画，教育部暂且置之不理，不愿干涉克林姆特的下一步创作，可是一波未平，一波又起，他在一年后完成的《医学》壁画5更是激起公愤。画面展现的不是死与生的截然对立，没有将医学塑造成提供治疗和救助的艺术与科学，而是万事万物皆处于永恒的生成变化、衰老消亡状态。维也纳分离派的创作成员之一、奥地利象征主义画家施托尔（ErnstSt?hr）指出：“生命发生在生成与消逝之间，生命本身从生到死的路程造成深重的痛苦，埃斯库拉普具有神力的女儿，药神（Hygieia）为此找到了缓解和疗救之道。”这幅画在“分离派”的展览中展出，刊印在“分离派”杂志上，画上的**却导致这期杂志遭到没收查禁。教育部也因此没有将克里姆特任命为维也纳造型艺术学院教授。
5 克里姆特，壁画《医学》，1901
克里姆特在愤懑之际，于1902年完成第三幅壁画《法学》6，这幅作品更是引起轩然大波。画面中央最引人注目的形象是被制裁者：一位瘦骨嶙峋、弯腰驼背、赤身**的老者，仿佛即将被缠绕着他身体的海葵吞噬。司法部门在此没有被塑造成可以为社会带来福祉与秩序的法庭，而是对民众施以严酷的惩罚和报复的机构。老者的头顶上方是古希腊神话里的三位复仇女神，她们代表着司法执行官；画面顶端是代表真理、正义和法律的三位女神形象，很不显眼。画家在此融合了自然主义式的描绘和装饰性图案。
1904年，官方不允许克里姆特把这幅作品送至巴黎参展，并拒绝接受这三幅壁画，将壁画任务委托给他人，克里姆特退还所有预付款，取回作品。这三幅作品被两位犹太商人购买，在纳粹统治期间被没收，存放在伊姆登多夫宫殿（Immdendorf）里。1945年，纳粹军队在仓皇逃离前，将之焚毁。
6 克里姆特，壁画《法学》，1902
