2006年8月，中国高等教育学会特殊教育研究分会和中国教育学会特殊教育分会在北京师范大学联合召开年会。本次会议是中国特殊教育历史上第一次基础特殊教育与高等特殊教育联合召开的年会，具有特殊意义。2007年9月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在长春大学特殊教育学院召开年会，主题是“中国高等特殊教育二十年回顾与展望”。2008年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在山东烟台滨州医学院召开年会，主题内容有：残疾人高等教育中的融合教育与社会和谐发展、特殊教育师范专业人才培养模式、教师教育。2010年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在重庆师范大学召开年会，主题是“专业、支持、和谐”。2011年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在北京联合大学特殊教育学院召开换届大会暨2011年学术年会，主题是“融合、质量、创新”。会议选举产生了中国高等教育学会特殊教育研究分会第二届理事会和常务理事，正、副理事长，正、副秘书长；决定由朴永馨担任名誉理事长，方俊明接任理事长，滕祥东继任秘书长。2012年9月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在陕西师范大学教育学院召开年会，主题内容有：特殊教育师资的培养问题，省级特殊教育培训基地建设的研究，残疾人高等教育问题研究，普通高等学校残疾人融合教育问题研究。2013年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在华中师范大学教育学院召开年会，主题内容有：特殊教育学科与课程建设，特殊教育师资的培养问题，高等特殊教育的国际比较及我国残疾人高等教育发展。2014年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在泉州师范学院召开年会，主题是“公平融合改革提升”。2015年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在南京特殊教育师范学院召开年会，主题是“支持保障改革创新提升质量”。2016年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在天津体育学院召开年会，主题是“形成学界共识深化特教改革促进内涵发展”。2017年11月，中国高等教育学会特殊教育研究分会在浙江特殊教育职业学院召开年会，主题是“深化改革，融合创新”。
年会的召开紧紧围绕着社会发展的需求，明确特殊教育学学科建设和残疾人高等教育服务社会的方针，规范特殊教育学的学科建设，推进了学科概念逻辑体系、学科性质、学科构建等方面内容的进一步研究与学术交流。特殊教育学学科建设任重而道远，也是历年学术年会的重要话题。在这个时期，我国特殊教育学作为一门新兴的学科逐渐走向成熟。作为一个较新的学科，虽然特殊教育的发展面临着各种问题和困境，但是特殊教育工作者要为实现特殊教育的中国梦而共同努力。正如朴永馨所言，特殊教育的发展要博采众长，勇于创新。在当前改革开放鲜明的特色下，中国特殊教育发展要具有中国特色，要正确认识特殊教育的任务和目标，正确认识发挥潜能和补偿的辩证关系，确定发展的途径和事业学科发展的方向。
（二）中国教育学会特殊教育分会
