作为进行学术交流的学术共同体组织机构，学会同样是学科研究制度化不可或缺的。2005年以来，在我国特殊教育有关领域积极开展学术交流、对特殊教育学学科发展起积极推动作用的学术组织机构主要有中国高等教育学会特殊教育研究分会、中国教育学会特殊教育分会，以及中国残疾人康复协会、中国心理卫生协会残疾人心理卫生分会、中国教育技术协会教育康复专业委员会等其他与特殊教育有关的学术组织机构。
（一）中国高等教育学会特殊教育研究分会
中国高等教育学会特殊教育研究分会是中国高等特殊教育领域专门的群众性学术团体，成员包括残疾人高等教育工作者和为残疾人事业培养专业人员的各类高等教育工作者。该研究分会于2001年开始筹建，于2001年在北京联合大学特殊教育学院、2002年在华东师范大学学前教育与特殊教育学院、2003年在长春大学特殊教育学院、2003年在南京特殊教育职业技术学院、2004年在天津理工大学聋人工学院召开筹建会议，讨论推进中国高等教育学会特殊教育研究分会的筹备建设情况，并举办不同主题的学术研讨会，如残疾人高等职业教育（2003年，长春），特殊教育高等师范（2003年，南京），残疾人高等特殊教育和高等特殊教育专业的教师培养问题（2004年，天津）。
2005年以后，中国高等教育学会特殊教育研究分会的发展历程主要如下。2005年7月29日，经中华人民共和国民政部（民社登〔2005〕第392号）批准，正式成立中国高等教育学会特殊教育研究分会。2005年10月，在河南郑州中州大学（现郑州工程技术学院）召开中国高等教育学会特殊教育研究分会成立大会暨2005年学术年会，选举产生了中国高等教育学会特殊教育研究分会第一届理事会和常务理事，正、副理事长，正、副秘书长。理事长由朴永馨担任；秘书长由曲学利担任，后由滕祥东接任。
学术年会内容涉及讨论建立高等特殊教育的有关理论与实践问题，研讨如何提高高等特殊教育办学层次（包括残疾人教育）、残疾人高等教育中教育技术的应用问题、中国特殊教育师资培养的历史研究及其他内容。
