别茨科伊在1763年回国后即向女皇呈递了一份学校改革计划，该计划在1764年被批准，称之为《男女青少年教育的基本制度》（或译《男女青少年教育总则》）。以后，他又提出了为“弃子孤儿”设立教养院的建议，并为教养院和陆军贵族士官学校制定了规章。他的教育思想便体现在这些文件和其他作品中。
按照别茨科伊的观点，教育是一切善的根源，对社会生活的改进发挥着巨大的作用。他认为，俄国必须通过建立寄宿制的教育和教养机构从各个阶层培养出“新型的人”，以便在专制国家利益的基础上缓和阶级的对抗性。他所说的“新型的人”包括能以人道态度对待农民并公正地管理国家事务的有教养的贵族和能从事工业、商业、手工业的“第三等级”。[78]他希望这些受到寄宿学校教育的人能把他们养成的观点和习惯传给自己的孩子，而后者又传给下一代人，从而逐渐改变人的道德和行为，使社会获得进步。别茨科伊强调，形成第一代“新型的人”的必要条件是使受教育的学生与社会的不良影响和老一代人的成见、恶行隔离开来。因此，按照他的计划，儿童必须从5～18岁都留在寄宿制教育与教养机构中接受教育。
从上述目的出发，在18世纪60年代至70年代初，别茨科伊在俄国为5～6岁的儿童至18～20岁的青年建立了各种带有等级性质的寄宿制教育机构，其中包括莫斯科教养院和彼得堡教养院、彼得堡艺术研究院附属中等艺术教育学校、斯莫尔尼贵族女子学院和陆军贵族士官学校附属市民学校等。
别茨科伊在1763年向叶卡捷琳娜二世提出了关于为“弃子孤儿”设立教养院的建议。莫斯科教养院于1764年成立，由别茨科伊担任院长。教养院收容的儿童在两岁前由保育员照管，两岁以后的教育工作按2～7岁、7～11岁和11～14岁三个年龄组进行。别茨科伊制订了《莫斯科教养院总体计划》，编著了以《从初生到少年期的儿童教育论文选集》为书名的教育指南，以指导教养院的工作。他注重德育和体育，认为劝诫儿童“敬畏上帝”、把儿童与周围环境隔离起来和良好的榜样是道德教育的主要手段；鼓励儿童爱好劳动，注意培养他们不游手好闲的习惯。在体育方面，他认为新鲜空气及无害的游戏和娱乐、劳动都是发展儿童体力并使他们健康成长的手段。在智育方面，他认为学习过程对儿童应该是愉快的，反对强迫儿童学习。在《莫斯科教养院总体计划》中，他强调坚决反对对儿童进行体罚。1773年，他创办了附设于莫斯科教养院的商业学校。这是俄国的第一所中等商业专业教育机构，是由当时俄国最大的企业家兼地主杰米多夫家族成员出资创办的。这一附属专业教育机构的建立为莫斯科教养院学生接受中等专业教育创造了条件。
在莫斯科教养院的影响下，1770年彼得堡又开办了一所新的教养院，以后有些省城也开办了教养院。这些教养院的工作也接受别茨科伊的指导。1802年，彼得堡教养院还在彼得堡近郊加特契纳（Гатчина）创办了一所教养院。19世纪前期，一些俄国教育家都曾为改进这所教养院的教育工作尽力。1854年，俄国著名教育家康·德·乌申斯基（К.Д.Ушинский）曾在这里担任教师和学监。
从1764年起，别茨科伊开始担任彼得堡艺术研究院的院长。18世纪70年代初，学院中开始形成进行职业训练的学院教育体制并设立了附属于研究院的中等艺术教育学校，招收5～6岁的男孩入学，进行15年的普通教育和艺术专业教育。学习期分为5个年龄段，每段3年。艺术专业教育按3个阶段进行：第一阶段描摹匠师范品；第二阶段画石膏像；第三阶段学习人像写生。别茨科伊领导艺术研究院直至1794年，第二年他就去世了。他为俄国艺术教育的发展作出了贡献。
