明代的学校有完备的教学制度，可以有效地制约和规范生员的发展。国子监的教学制度分为坐监和历事两大部分。以坐监即在校学习为主。教学内容有《御制大诰》、《大明律令》、《四书》、《五经》、《说苑》等。最重要的是《大诰》，礼部责令教官，严督诸生熟读讲解，有不遵者以违制论。教学内容贯穿着专制的文教政策。国子监的教学安排以月为单位，教学活动主要有讲书、习字、背书、作文四项。讲书即教官授课，讲解经书。每日早晨，举行隆重的全校会讲，其他则由博士、助教、学正、学录分班复讲。习字即每日须写二百余字，必须端楷有本。背书即背诵经书及其他规定教材。每三日一次背书，每次须读《大诰》100字，《本经》100字，《四书》100字，不仅要求熟记文词，而且还要通晓大义。作文即练习各种文体写作。每月务要作课，四书义一道，本经义一道，论一道，诏诰表章等公文一道，均须按月送改，不得拖延。从这些教学活动来看，国子监的教学做到了计划与检查相结合，正课与自习相结合，教师指导与生员练习相结合，整个教学活动安排有条不紊，忙而不乱。所谓历事，是分配监生到政府各衙门历练政事。监生历事始于洪武五年（1372年）。建文时定考核品级，永乐年间有选监生直接入翰林者。至仁宗时，历事生不许直接授官，历事期满后仍回监读书，由科举入仕。监生历事依其在监学习成绩的高下，安排到各个不同的部门，而且名额都有规定。历事时间有三个月、半年、一年不等，亦有以事来定期的，事完期满。监生历事制度为明代首创，后为清代所承继。它包括了历事监生的资格、权力、任务、待遇、考核以及历事时间等一系列规定，它的推行有利于监生在学期间熟悉和了解政事，培养实际从政的能力，也有利于检查教学质量。但监生历事期满后可直接入仕，因而在鼓励监生历事热情的同时，也产生了只重形式、不求实学等诸多流弊。
明代地方学校的教学制度也比较完备。教学内容以五经六科教授学生。洪武初年，令生员“专治一经，以礼、乐、射、书、数，设科分教”。以后又有调整，重点以礼、射、书、数四科为教。关于礼的内容，要求诸生熟读朝廷所颁布的经、史、律、诰，以备应科贡考试。关于射的内容，规定每月朔望练习射法。关于书的内容，要求生员依临名人法帖，每日习500字。关于数的内容，要求务须精通《九章》之法。这些内容虽然较之国子监浅易，但按“务求实才”的要求看，还是注重了基本知识和基本技能的培养。地方学校也有岁考、科考等规制，由地方学校教官主持。岁考是成绩测验，按六等分优劣，关系到生员能否补入正式生员资格和受到降级、除名和扣除廪膳的惩罚。科考可算是毕业考试，一二等者可取得乡试资格或出贡资格，三等不得应乡试，三等以下有罚。因这两次考试对生员前途关系重大，甚至对地方教官也有影响，因而平日教学自然也不敢松懈。
明代的学校管理也趋于完备和严格。国子监的监规禁例条目繁多，除了要遵守明太祖向全国学校颁行的“卧碑文”学规禁例外，还有自己的监规。《明史·选举志一》载：“每班选一人充斋长，督诸生工课。衣冠、步履、饮食，必严饬中节。夜必宿监，有故而出必告本班教官，令斋长帅之以白祭酒。监丞置集愆簿，有不遵者书之，再三犯者决责，四犯者至发遣安置。其学规条目，屡次更定，宽严得其中。堂宇宿舍，饮馔澡浴，俱有禁例。”这说明明代国子监生是分班管理的。明代班级有多大，史书无载。每堂有教官分工负责，每班有斋长具体掌管。斋长由监生中选出，以督促各项监规的遵行。
