在数学和天文历法方面，还在明末，传教士利玛窦和明朝官员徐光启、李之藻翻译了《几何原本》、《同文算指》，欧洲数学开始传入中国。《几何原本》是根据德国数学家克拉维斯的注释本（，）译出的，对人们了解和研究几何学非常有益，中国清代数学家方中通、李子金、梅文鼎等都从中受到很大影响。《同文算指》是一部介绍欧洲笔算的著作，主要依据克拉维斯《实用算术概论》（Clavius，EpitomeAritnmeticaepracticae）和程大位《算法统宗》编译而成。《同文算指》介绍的笔算简便可行，经过清代数学家的改进，在中国得到了普遍推广。著名的《崇祯历书》中，大量介绍了西方平面三角学和球面三角学的知识。清初，波兰传教士穆尼阁（JeanNicolausSmogolenski）又把对数解球面三角形的方法介绍给了中国数学界。对数便于计算，极有实用价值，在历法计算上被普遍应用。在此基础上，中国数学家薛凤祚、方中通等后来均有新的发明。康熙年间编辑的《数理精蕴》，是欧洲数学传入中国后集大成的著作，雍正元年（1723年）出版后，中国的数学研究出现**。该书对欧洲的代数学，以假借根数、方数求实数、对数比例、比例规解等均有介绍，是一部影响较大的著作。在欧洲数学的影响和启发下，清中叶的明安图、董祐成等人在三角函数和反三角函数的幂级数展开式的研究中，都取得了重大成果。
欧洲天文历法方面知识也是在明末传入中国的。利玛窦、庞迪我等传教士前来中国时，都带有望远镜等天文仪器。到达中国后，根据实际需要，这些仪器或加以仿制，或者重新设计、制造。继传教士汤若望监制的第一架望远镜“窥筩”正式安装后，康熙年间，传教士南怀仁曾主持设计、监造天体仪、象限仪、纪限仪、地平经仪、赤道经纬仪、黄道经纬仪等六件大型铜仪。中国科学家对此给予很高评价，认为“西法之有验于天，实仪象有以先之也”[59]。明末，徐光启起用欧洲传教士龙华民、邓玉函，以及精通西方天文学的中国知识分子李之藻等人，编成《崇祯历书》137卷。后来，南怀仁等又编成《康熙永年历法》32卷。这两次历法编纂，完成了旧历法改革，从此中国通用西历。在编纂历书过程中，欧洲天文学说在中国得到进一步传播，一些测量方法也被系统介绍给中国天文学界。其中，耶稣会士罗雅谷首先介绍了伽利略学说；法国耶稣会士蒋友仁则对日心说作了明确介绍；清代杰出的天文学家王锡阐“精究推步，兼通中西之学”[60]，在介绍欧洲天文历法等科学知识方面，做出了重要贡献。
