清前期，蒙古、藏、维吾尔、彝等少数民族的史学有所发展。
一、蒙古族史学
成书于清代康熙元年（1662年）的《蒙古源流》是这一时期蒙古族史学中的一部巨著。本书原名为《额尔德尼·托卜赤》，简译为《宝贝史纲》，是鄂尔多斯蒙古族学者萨囊彻辰以蒙古文写成的。这部蒙古文史学著作由喀尔喀亲王成衮扎布把家传抄本进献给乾隆帝后，奉敕译成满文，并由满文译成汉文，名《钦定蒙古源流》，收入《四库全书》史部。这部蒙古编年史记载了元、明两代蒙古各汗的事迹，尤以达延汗与俺答汗的记述更为详尽。本书是研究蒙古历史的重要著作，与《元朝秘史》、《蒙古黄金史》合称为蒙古族三大历史著作。
这一时期的史学著作中，还有克什克腾旗的拉西彭楚克的《大元盛朝史》、噶尔丹台吉的《宝贝念珠》以及成书于19世纪上半期的《水晶鉴》等。此外，还有一些精通汉文的蒙古族学者用汉文撰写的著作，如博明的《西斋偶得》、《凤城琐录》和松筠的《绥服纪略》等，对蒙古族的历史与地理均有所考订与论证。
这一时期，有关卫拉特蒙古的几种托忒文史学著作是值得重视的，这些史学著作对研究卫拉特蒙古史和北方民族关系史有着重要参考价值。应该提到的是《咱雅班第达传》，这是一本论述和硕特喇嘛僧咱雅班第达的传记，但本书论述的内容并未局限于咱雅班第达个人的一生活动，而是以咱雅班第达一生活动为主线，揭示出当时卫拉特蒙古各部的社会状况、政治变迁以及与喀尔喀蒙古和西藏的关系，为研究17世纪上半期的蒙古史和蒙藏关系史提供了可贵的资料。本书作者拉特纳哈德勒是咱雅班第达的弟子，追随其师学佛传教，对其师一生活动十分知情，故其所记颇为真实可靠。本书大约完成于1690年前后。
三种《四卫拉特史》也是研究卫拉特历史的重要著作。第一种加班沙拉勃著的《四卫拉特史》，本书我国内蒙古自治区社会科学院历史研究所藏有它的托忒文铅印本，书名为《卫拉特简史》。据说本书托忒文原本藏于苏联彼得格勒日丹诺夫大学图书馆，它被译成俄文，名为《关于卫拉特人的故事》。[61]本书作者是土尔扈特部医生，据说于1739年写成。第二种《四卫拉特史》是由和硕特诺颜巴图尔乌巴什丘缅撰写的，俄国学者雷特金把本书译成俄文，书名《关于杜尔本——卫拉特人的故事》，发表于1859—1860年《阿斯特拉罕省报》。苏联学者认为该书成书于1819年。第三种《四卫拉特史》的抄本保存于蒙古国国立图书馆，该书作者不详，据蒙古学者认为成书于1751年。
二、藏族史学
藏族是一个富有历史记录的民族，但其史学著作多与文学、宗教结合在一起。
《西藏王臣史》，作者阿旺罗桑嘉措，是藏传佛教格鲁派的五世达赖。万历四十五年（1617年）生于前藏琼结地方。他一生著述很多，对西藏政治与宗教方面都有很大的贡献。他的这部《西藏王臣史》是应顾实汗请求而写的，本书于康熙二十一年（1682年）问世。该书详细记述了自西藏有史以来直至顾实汗之间历代王朝的历史，其中对帕竹噶举兴衰的历史记载尤为详细。它是研究西藏学及其有关历史的珍贵史料，在国内外有一定影响，1982年，我国民族出版社出版了该书的汉译本。[62]
