《聊斋志异》写得最多的是狐鬼精怪与人恋爱的故事。作者通过这类曲折奇异的爱情题材，歌颂自由纯洁的爱情生活，揭露封建礼教的虚伪本质，寄托着人们对美好爱情的理想和向往。著名的篇章如《红玉》、《婴宁》、《鸦头》、《莲香》、《姣娜》、《青凤》，等等。在这类故事中，女主人公都具有容貌美丽、心灵高贵、纯洁善良的特点，同时又具有鲜明的个性，如红玉的机智贤惠，婴宁的天真烂漫，青凤的痴情执着，等等。这些鲜明的女性形象，是作者幻想化的产物，集中体现了作者理想中的两性关系和理想化的女性，同时也表现出人们对美好生活普遍的渴望与憧憬。这样的爱情故事把读者带入一个神奇迷离的超现实世界中，女主人公为了追求自由平等的爱情生活，自始至终不屈服于封建礼教的束缚和压迫，为了自己所爱的人，舍生忘死，历尽劫难也在所不惜，毫不退让。《连城》写连城与心上人乔生俩人的爱情故事：史孝廉征诗择婿，乔生的诗才得到其女连城的喜爱，彼此引以为知己，但史孝廉以乔生家贫为借口，不答应这门亲事。两个人虽私下爱慕，却无法走到一起。不久，连城因情志不遂忧郁而死。乔生闻讯，前往吊唁，当场一恸而绝。他在阴间找到了连城，在其好友顾生的帮助之下，两个人被允许还魂人间，有情人最终成了眷属。相同题材的故事在全书中还有很多。这一题材在前代小说作品中多有反映，蒲松龄继承了前人的创作成就，并且在思想深度和生活广度上加以扩大。这些作品歌颂了男女主人公为争取婚姻自由所表现出的可贵品质和反抗精神，流露出作者进步的思想意识。
《聊斋志异》所表现的另外一个重大主题，是揭露和批判科举制度的弊端。作者本人对科举原本是一往情深，极为热衷，一直都在做着“朝为田舍郎，暮登天子堂”的美梦，却屡遭现实的无情捉弄。多年的科举之路，带给他的不是梦寐以求的荣华富贵，而是一次又一次的打击和无尽的屈辱。痛苦和失意使他清醒地认识到科举制度的弊病，也促使他操起笔管，用饱含感情的语言来编织一个又一个故事，通过对科举弊端的揭露和对一些知识分子精神面貌的剖析，批判了科举制度的腐朽。作者用生动真实的事例揭露了一些考官瞒顸、徇私舞弊和嫉贤妒能的嘴脸，抨击了封建社会埋没人才的现实。《叶生》、《司文郎》、《于是恶》、《贾奉雉》、《罗刹海市》、《续黄粱》等篇，就是这一类作品。
《司文郎》写一个能用鼻子嗅出文章好坏的瞎和尚，他嗅过王生的文章之后，说：“君初法大度，虽未逼真，亦近似矣。我适受之以脾。”再嗅余杭生的文章，则咳逆数声曰：“勿再投矣！格格而不能下，强受之以膈；再焚，则作恶矣。”可是榜发以后，余杭生高中，而瞎和尚看好的王生却名落孙山。和尚闻讯感叹道：“仆虽盲于目，而不盲于鼻；帘中人并鼻盲矣！”作品构思奇巧，寓意深刻，用辛辣的语言无情地嘲讽了科举制度的虚伪。《叶生》中的叶生，虽然“文章辞赋，冠绝当时”，偏偏屡试不中，郁闷而死，为了显示自己的才华，他的鬼魂帮助一个邑令之子考中举人，“借福泽为文章吐气，使天下人知半生沦落，非战之罪也”。这则故事既暴露了科举制度的埋没人才，也反映了广大士子对此道的执迷不悟，竟达到生死系之的地步。在作者笔下，没有走上仕途的士子汲汲以求，而一旦侥幸过关者，不少人则成了贪图功名利禄的社会蛀虫，鲜有能为国家和民众出力的人。相反，作者对那些不肯向科举制度低头屈服的读书人，则给予热情的赞扬，如《贾奉雉》中的贾生，最后抱着对科举之途的失望“遁迹丘山”，表现了一些士人幻想的破灭和梦醒之后无路可走的心态。这类作品，可以说是后来吴敬梓《儒林外史》全面揭露和批判封建科举制度的先声。
