在述及清前期传统医学理论发展的时候，我们还应谈到《医宗金鉴》一书。该书90卷，官修，吴谦主纂。吴谦，字六吉，安徽歙县人。官太医院判，供奉内廷。乾隆年间，敕编医书，太医院使钱斗保请发内府藏书，并征集天下家藏秘籍，及世传经验良方，分门聚类，删其驳杂，採其精粹，发其余蕴，补其未备，编书2部。一部小而约，供初学者诵读，一部大而博，供学成者参考。后来情况有所变化，乾隆皇帝希望尽快把书编成，一部即可。在这种情况下，吴谦为总修官之一，负责编写。吴谦认为，古医书有法无方，只有《伤寒论》、《金匮要略》、《杂病论》开始有法有方。《灵枢》、《素问》以后，两书实一脉相承，义理渊深，方法微奥，领会不准确，便很容易出错。旧注随文附会，难以传信。于是，吴谦自己删定，对二书的错误多所订正，逐条注释，并参考了以往诸家旧注有价值的部分，遂成一书，乾隆皇帝赐名《医宗金鉴》。该书内容比较全面，既有对仲景全书的订正，也有对名医方论的删补，还记述了四诊新法要诀、运气要诀、伤寒心法要诀、杂病心法要诀、妇科新法要诀、儿科心法要诀、针灸心法要诀、正背心法要诀等歌诀，是以往中医药学理论的总结和发展。
二、药物学与方剂学
清前期药物学有所发展，新的品种不断出现。这时期在药物学方面做出贡献的人有：赵学敏，字依吉，号恕轩，浙江钱塘（今杭州）人。明朝人李时珍编有《本草纲目》，赵学敏编《本草纲目拾遗》，记载药物921种，其中有716种为《本草纲目》所不载，是赵学敏补充的新药物。在分类方面，《本草纲目拾遗》也更为合理，全书共分18部，把《本草纲目》中的“人”部删去，把“金石”分为2部，增加“藤”部和“花”部。《本草纲目拾遗》还对《本草纲目》中的一些错误进行了订正。吴其浚，字瀹斋，河南固始人。他著有《植物名实图考》38卷。这是一部药用植物学专著，收录植物1714种。吴其浚把所有植物分成12类，对每种植物都详细记下颜色、形状、性味、产地、功用等，还配有插图，说明它的药用价值。对同一种药物而名称不同，或不同药物而名称相同，则进行详细考订。此外，这部书还对以往本草中的某些错误有所纠正，多所创见。汪昂，字讱庵。他根据《本草纲目》等书辑成《本草备要》一部，记载药物460余种，另附插图400余幅。对每味药物，汪昂都记下功效，也写出副作用，使人一目了然。吴仪洛，字遵程，他在《本草备要》的基础上，编成《本草从新》一书，记载药物720余种，比《本草备要》增加了近300种。[31]此外，前曾提到的张志聪对药物学也有所贡献，他曾“注《本草》，诠释本经，阐明药性，本五运六气之理。后人不经臆说，概置勿录”[32]。
刻有经络穴位的铜人
和药物学的进步一样，清前期在方剂学方面也比前代有所进展，不少新的著作问世。汪昂著有《医方集解》，吴仪洛著有《成方切用》。这两部书都选录了许多良方，对临床实用有很大的指导作用。此外，汪昂的《汤头歌诀》，陈念祖的《时方歌括》，读起来朗朗上口，便于记忆，对于初学用方剂的人很有帮助。根据《本草纲目》附方按类重新编排成书的，有蔡烈先《本草万方针线》、年希尧《本草纲目类方》、曹绳彦《万方类编》等。这些书在临证查验时非常方便。赵学敏根据著名“走方医”赵柏云医方删订而成的《串雅》一书，搜集了大量的民间秘方、验方，这些药方既可以用来内治，也可以用来外治，为整理和保存民间医疗经验做出了贡献。[33]
