元廷与伊儿汗国的医学交流也很广泛。旭烈兀身边就有中国医生，中国医学在元代传入了伊朗等地，受到了当地人的欢迎，有不少人学习中国医术。《史集》的作者、波斯人拉施特原是一个医学家，他主编的《伊儿汗的中国科学宝藏》一书，是一部关于中国医学的百科全书，如今传世的是土耳其医学家用土文翻译的。来中国侨居或在宫廷任职的波斯、阿拉伯医生也不少，元代文献中称之为“回回人”“西域人”或“大食人”。元朝在中央太医院下设有广惠司，掌管研制御用回回药物及和剂，治疗诸宿卫士及在京孤寒者，官阶为正三品。大都、上都均设有回回药物院，掌管有关回回的药物。信奉景教的西域人爱薛，在定宗贵由时来到和林，在拖雷孀妻唆鲁禾帖尼身边充当近侍。他“于西域诸国语、星历、医药，无不研习”。忽必烈当时还是藩王，也很赏识他，将他带往开平。即位后，命爱薛掌管西域星历、医药，后来改为广惠司，仍以爱薛管领。在广惠司任职的均是回回医生，诊病和用药都是按回回医法进行的。回回医生医术高明，深受汉族百姓欢迎，民间也有不少回回医生，王沂《伊滨集·老胡卖药歌》，记载了一位回回老医生：“西域贾胡年八十，一生技能人不及。神农百草旧知名，久客江南是乡邑。朝来街北暮街东，闻掷铜铃竞来集……金丝膏药熬较好，伤折近人人苦多。川船南通有新药，海上奇方效如昨。”西域所产药草疗效亦好：“火失剌把都者，回回田地所产药也。其形如木鳖子而小，可治一百二十种症。每证有汤引。”[66]这一则记载见于陶宗仪的《南村辍耕录》。该书还记载了几则回回医生医药高明的例子。大都一家小儿“患头疼，不可忍，有回回医官，用刀划开额上，取一小蟹，坚硬如石，尚能活动，顷焉方死，疼亦遄止”[67]。平江（江苏苏州）阊门有一旅客，所骑之马腹膨胀倒地，“店中偶有老回回见之，于左腿内割取小块出，不知何物也，其马随起，即骑而去”[68]。顺帝长公主驸马刚哈剌咱庆王，因坠马而得一奇疾，两眼失去黑眼珠，舌头伸至胸前，群医束手。广惠司长官聂只儿，是一个也里可温（元代对基督教徒和教士的通称），认识此症，将长舌剪去，顷刻间又生一舌，也被剪去，“又于真舌两侧各去一指许，却涂以药而愈”[69]。类似例子还有不少。广惠司曾组织人翻译过《回回药方》，有些被吸收入明朝人李时珍的《本草纲目》中。北京图书馆收藏的残本《回回药方》，为明刻本，是元代译成汉文的阿拉伯医学著作。有人考证，这本书就是阿拉伯医学家拜塔尔的《简救法》。《饮膳正要》一书是回回人忽思慧所著，这本专为皇家编著的食谱中，记有不少回回食物的烹调方法和营养价值，以及回回药物与方剂等。
拉施特的《史集》是一部世界名著，是人们研究蒙古史和元史的必备之书。为作者提供最大帮助的是孛罗。孛罗为蒙古朵儿边氏人，在元朝任过御史中丞、大司农卿、御史大夫、枢密副使等要职。至元二十年（1283年），他以丞相衔出使伊儿汗国，爱薛为副使。他们在伊朗觐见了阿鲁浑汗，孛罗留仕伊儿汗廷，爱薛则返回元朝。孛罗知识渊博，熟悉蒙古历史及元朝典章制度，由他口述，拉施特记录而成的《史集》，具有极高的学术价值。孛罗还把元朝的钞法详尽地介绍到伊儿汗国。当时伊儿汗国的君主奢侈无度，弄得财政拮据，国库空虚，便采用孛罗的建议，在全国发行纸币，并在各地设立钞库，负责发行新钞，倒换昏钞。钞上印有八个汉字，中间印有钞值。中国的雕版印刷技术从此传入波斯和阿拉伯。
牌符制度也是由元朝传入伊儿汗国的。作为权力的凭证和身份的标志，汗国的牌符分为几种，“诸算端（诸侯）、统将、蔑力克（州的长官）佩圆形大虎符，地位较低的牌面略小些。使者驰驿，则给以圆牌，上著‘官牌’字样，使命完成时即将牌子交还。各边区长官需遣使乘急递铺马递送紧急军情者，也发给五至三面圆牌”[70]。
元朝各宗藩国虽是独立的，但在名义上还是元朝皇帝的属国。至元年间忽必烈命秘书监修《大元一统志》时，让各行省进呈本省地图与图说，宗藩国可能也不例外。今存残本《大元一统志》虽未发现藩国部分，但元文宗时修成的《经世大典》地图，却标有伊儿汗国主要城市、地区的名称及位置。大食学者赡思自著有《西国图经》一书，并参与过《经世大典》的修纂工作，他把波斯、阿拉伯的地理知识介绍到中国来，为元朝与伊儿汗国的文化交流做出了贡献。
