这巴斯德跃马横刀闯入微生物领域，便势如破竹，如入无人之境（本来，以前也没有几个人涉猎这里）。他先帮助葡萄产地的农民解决了防止酒变酸的难题。说来简单，只要把酒加热到55℃，就可以将细菌杀死，这就是后来被普遍采用的“巴氏消毒法”。他发现了寄生在蚕身上的微生物，挽救了全法国的养蚕业；他发现了羊炭疽杆菌，并治好了羊炭疽病，挽回了2000万法郎的损失。他由此又推断出：人身上的传染病，也是由这些看不见的杀人犯传播的。这可是一个大胆的结论，这就不是化学，也不是微生物学的事了，巴斯德已经扬鞭催马踏入了医学的领地。当时的欧洲正对突然间流行全境的瘟疫束手无策，在俄国的一个乡村里，深更半夜，男人们起来把四个寡妇绑在犁上，赶着她们绕村犁上一圈，认为这样就可以抵挡瘟疫，而医生们也只知降温、放血，或开点儿不顶用的药丸。现在巴斯德突然闯了进来说：“这些统统都是骗人的！”于是，整个医学界就像一个被捅了的马蜂窝。
巴斯德是一个性格豪爽，拼命向前，苦干务实，想到就要说、要做的人，况且他也不大会装出一种谦虚去争取同情。他手头有了许多实验事实之后，就到处做学术报告，做科普宣传，而且态度直率，语言尖刻。在一次学术会上他说：“我真够聪明的，我居然能发现这一切，而你们真傻，竟到现在还不肯相信。”
一次巴黎举行科普讲座，会场里本来灯火通明，他突然将灯全部熄灭，然后打出一束光划破黑暗，只见这光中许多细小的微粒上下翻动。他指着这些微粒说：“你们看见了吧？斑疹伤寒、霍乱、黄热病……一切传染病菌就都在这些小微粒上面。你们不要小看这些小东西，它能量之大绝不亚于狂风暴雨。比如一种破坏酒精的微生物，几天之内能使比自己重100万倍的酒精变成醋，好比一个200磅体重的人，几天之内就可以劈掉200万磅木材，谁能有这么大的力气？如果这种病菌钻入人体，不难想象，欧洲几天之内就会尸横遍野……”
巴斯德这些话使听众们不寒而栗。包括那个大小说家大仲马，那天他也在场，无论他曾构思过多么惊险的小说，也不如巴斯德这几句话叫大家瞠目结舌。
好像别人都是聋子，都是瞎子，巴斯德大声向人们讲着他听到的、看到的一切。而大家都觉得他实在是个疯子，因为他们每一个人都既没有听到什么，也没有看到什么。因此，他们对这个疯子搅得他们上下不安简直不能容忍。他们开始在自己还占绝对优势的阵地——学术会议、各种刊物、报纸上——指名道姓地攻击巴斯德了。但是他毫不退让。
这天，巴黎医学会又举行一次医学报告会，讨论当时死亡率达90%的产褥热，还有外科手术感染问题。一个叫奎茵的顽固老头正在夸夸其谈这种病的病因，突然前排站起一个人说：“完全是胡说八道！这些病首先得由你们医生、护士负责，是你们的手、医院里的床，还有手术刀、绷带，将那些致病微生物传给一个病人，又传给另一个病人，你们还全然不知。医院成了殡仪馆的前厅，手术台成了杀人台，你们却死抱住旧习惯不放，还在每天杀人。我昨天刚收到一封信，是苏格兰医生李斯特先生的，他在手术前将双手、刀具、纱布，甚至刀口周围都用硼酸彻底消毒，结果病人死亡率从90%一下就降到15%。”此人正是巴斯德。
这时下面有人摇头，有人很注意地听，而奎茵早就不耐烦了，他打断巴斯德的话说：“你总是这样像巫婆念咒似的叨叨，可是你说的可怕的微生物到底在哪里？它怎么能有这么大的本事？怎么能无孔不入地传播？你能给我看一看吗，它到底是什么样子？”
巴斯德三步两步迈到黑板前面画了一个链状物，说：“引起产褥热的就是这种菌。”
奎茵冷笑一声：“算了吧，你口口声声说我们没有见过微生物，倒是你恐怕连手术刀、绷带也没有摸过呢。”
