清军入关后，中原局势发生了出乎意料的变化。此前势如破竹的大顺军屡战屡败，直到败亡都没打一次像样的胜仗。一部分原明军将领没向南明效忠，而是投降清朝，成为清军先锋。在短暂时间内，原先被挡在关外几十年的清军，进关后如猛虎下山，追打大顺军、追打大西军、追打南明军，一副天下“谁不服我打谁”“谁跟我对着干消灭谁”的架势。
清军横扫天下，部分降清的人，被清朝高规格表彰，晋封为藩王，镇守地方。他们是为清朝立下汗马功劳的吴三桂、尚可喜、耿精忠，分别镇守云南、广东、福建。他们原本以为从此可以子子孙孙享受富贵，但没想到清朝基本统一天下后，他们的富贵也将要成为历史。
清朝原国号是金（史称后金），是关外建州卫的努尔哈赤于1616年建立的。1616年是明朝皇帝朱翊钧在位第44年。20年后，后金改国号清。1644年，吴三桂献关，清军入关，多尔衮带领年幼的顺治皇帝爱新觉罗·福临迁都北京。在吴三桂、尚可喜、耿精忠等一批降清文臣武将引领下，清军攻打大顺军、大西军、南明军以及各种不服从的武装，很快将反对者消灭，统一天下。
多尔衮、福临先后去世后，年幼的康熙皇帝爱新觉罗·玄烨继位，一个新时代来临了。玄烨年幼继位，但机遇极好，随着天下统一，战火平息，清朝统治下人口增加、耕地增多，物产丰盈，国力也日益强势起来。鳌拜辅政，目空一切，但被玄烨以迅雷不及掩耳之势除掉。玄烨趁机废除辅政大臣权力，将朝政大权集中到手中。
玄烨亲政后，巩固和加强对地方的控制。吴三桂、尚可喜、耿精忠三个藩王是要除掉的另类。1673年，玄烨精心准备后，下诏废除各藩王。吴三桂、尚之信（尚可喜长子）、耿精忠瞬间有卸磨杀驴的悲愤。尤其是吴三桂，当年手握十几万精兵，势力并不小清军多少，而且是决定天下走势的关键力量。为了打击大顺军，他不惜背着汉奸骂名献关，为清军先锋平定天下。清朝取得天下，吴三桂居功至伟。
更感到悲愤的是，为取得清朝的信任，他还将所有心向明朝的人得罪。他率军进入缅甸，逼迫缅王交出逃到缅甸境内避难的南明永历帝朱由榔，并亲手杀死朱由榔。当时，清朝各地有反清复明倾向的明朝遗民。吴三桂这样一做，将反清的民意基础亲自摧毁了。
吴三桂不甘心被宰杀，杀死云南巡抚朱治国，提出“兴明讨虏”，自称天下招讨兵马大元帅，起兵反清。虽然吴三桂提出“兴明讨虏”有非常大的讽刺性，但他还是获得反清复明百姓的支持。吴三桂派兵分别从云南和贵州进攻湖南，占领了湖南全省。四川各地官僚主动投降吴三桂，参加“兴明讨虏”。福建、广东、广西、陕西、湖北、河南、台湾等地的汉官汉兵以及少数民族上层人士、各地农民，也都积极响应“兴明讨虏”。在这种大好形势下，吴三桂不积极率军北伐收复中原，而是在湖南沿江修筑防御工事。
玄烨预料到吴三桂要造反，但没预料到吴三桂战略短视，便冷静下来调整战略。他派人去招抚另外两个藩王，以孤立吴三桂，给天下人制造“削藩是镇压不忠之臣吴三桂，不是针对其他汉官”的印象。玄烨此举起到立竿见影的效果，一部分汉官汉人对吴三桂不满的情绪被放大，不再支持他，甚至期待清军迅速消灭掉他。
在另外两个藩王再次归顺清朝后，吴三桂愤怒至极，头脑发昏，做了一件加速灭亡的事——他于1678年在衡州称帝，建国号大周。此举无法加强反清的凝聚力和号召力，反而坐实他“不臣”的事实——表明他反清不是为了兴明，而是为了自己称帝。
原来，吴三桂辜负崇祯帝，剿灭大顺帝，背叛康熙帝，一切都是为了他自己称帝。天下人对吴三桂有了这种认识后，支持他的人越来越少。吴三桂手下的将士越来越少。不久，身败名裂、穷途末路的吴三桂郁闷而死。其子吴世璠继位后，于1681年被清军围困在昆明城。在众叛亲离情况下，吴世璠自杀。
藩王吴三桂被消灭掉后，另外两个小藩王也只有乖乖就范了。玄烨下令彻底废除藩镇制。到1683年，清军又顺利收复了台湾。从此，有组织成建制的公开反清军不复存在。玄烨集中精力进行财政经济改革，解决其他边疆问题，完全掌控着历史发展方向。他充分发挥个人雄才大略，经过几十年努力，开创长达百余年的康乾盛世。
