有了属于自己的平台，吴亚军正式进军房地产业。这次与她联手的是中建科。这家公司隶属于大名鼎鼎的中国建筑集团，实力不一般。双方合资组建了中建科置业公司，吴亚军持股45%。
她的第一个项目是龙湖南苑，一出手就成了经典。
重庆北部的新牌坊社区，现在绿树成荫，九龙湖蜿蜒曲折、水波**漾。龙湖南苑就座落在这里。1997年，吴亚军落子此地时，这里连道路都没有，一片泥泞。吴亚军却信心十足。她全身心地投入到项目之中，甚至一棵树的位置、辅路的颜色，都亲自过问。这个重庆首个封闭式花园小区，绿地覆盖率达到45%，一上市就引来赞誉一片，20万平米的项目，迅速抢购一空。南苑项目被评为1998年重庆市“十佳住宅小区”，位列第一。吴亚军由此名声大振，公司名字也改为了龙湖地产。
就在吴亚军南苑项目大获成功时，公司的大股东中建科却在分步退出。1999年，它转让给吴亚军11.25%股权，每股价格仅为1元。吴亚军的持股由此超过了56%。2003年10月，中建科转让了最后5%股权。吴亚军成为了龙湖惟一的主人。
此时，国家接连出台一系列政策，地产业迎来一段热闹非凡的“黄金时期”。龙湖乘着这股东风，一路高歌猛进。龙湖西苑、香樟林别墅、重庆北城天街，一个个项目相继落成。2005年，龙湖走出重庆，进军成都、北京。每到一地，龙湖总能掀起不小的波澜。在北京，滟澜山及香醍漫步推出时，预售第一天，以高价位分别售出95%及100%，引起轰动。到2006年底，龙湖地产累计已开发面积约185万平方米，在建面积约230万平方米，规划面积约1100万平方米。龙湖集团重庆成都两地销售总额突破38亿元，成为西部地区首家销售额突破30亿的房地产企业。
2007年4月，地产界就传出消息，龙湖即将赴香港上市。但2008年的金融危机让龙湖的上市“急刹车”，一直到2009年，才得以重启。当年11月19日，龙湖正式在香港联交所挂牌。龙湖得到各大机构和投资者的追捧，国际资本大鳄索罗斯认购2亿港元。上市完成之后，吴亚军持股46.9%，蔡奎持股31.3%。按照上市当天的收盘价每股8.01港元计算，吴亚军夫妻的身家超过310亿港元。
多面女老板
吴亚军用了16年的时间，创造了别人永远不可能企及的财富。在这个过程中，有传言吴背景深厚，但她自己从来对此不作解释，了解她的人都知道，这是一个“不干活就会死”的人，她简单又多面的个性，让她走的比别人快，比别人远。
创业之初，为了省点钱，吴亚军就租了一间教室当办公室，一半办公，一半给员工住，上个厕所都得跑老远。吃饭不方便，她就准备了一箱箱的方便面。重庆天气潮湿，吃到最后，员工发现方便面里多了些“肉”：都长了虫。即使发了家，她的习惯也没有改多少。有一次她带着高管去绿城考察，到了饭口，她婉拒了对方的招待，领着下属们到门口的面馆，每个人吃了9块钱一碗的小面。她的办公室只有十几平米，长时间没有秘书，好多演讲稿都自己写。“抠门”的吴亚军对员工却格外大方。龙湖上市时，共有940多名主力员工，持有股票的多达550人，持股1.1亿股，按照上市当天的收盘价，这些股票价值8亿多港元，平均每人分到150多万元。吴亚军表示，这是员工应得的，并称这是一个“小礼物”。有人曾开玩笑说，当年一辆保时捷的价格140万元左右，龙湖的这个小礼物相当于每人一辆保时捷。
