负责镇守泉州的大将正是郑芝龙的弟弟郑芝豹，郑芝豹怎么也没有想到，绍武帝居然会在这个时候选择逃离泉州，连皇帝的位子都不要了，所以起初有人禀告他，说都指挥佥事方正明带领千余明军旧部，离开泉州的时候，他还没怎么在意，只是派人去追上方正明，问其要做什么。
而方正明则回答，说奉旨前往漳州府，增援在漳州府以南的兵马，而这个时候绍武朝的军事方面并没有统一，虽说以郑芝龙的郑军实力最强，但是毕竟郑芝龙并未控制全部兵马，一些福建的明军并没有全部接受郑芝龙的统御，故此虽然郑芝豹有点怀疑方正明此行的目的，但是起初他以为最多方正明也就是看不惯他们郑家把持绍武朝的军权，想要离开这里罢了。
对于那千余名明军，郑芝豹也没想怎么样他们，他们走了正好，也省的他们郑家要出钱出饷来养活他们了。
但是随后郑芝豹才发现，事情没有他想的那么简单，方正明跑的时候，张肯唐也不见了踪影，接着宫中传出消息，说绍武帝也突然失踪了，郑芝豹这才意识到出大事了。
于是郑芝豹一边派人立即快马加鞭朝南追赶绍武帝一行人，一边赶紧派人给郑芝龙报信。
但是这个时候他动作已经慢了许多，绍武帝在张肯唐和方正明等人的护送下，已经远离了泉州府，快要进入到漳州府了。
郑芝龙听闻这个消息的时候，绍武帝已经跑了快一天时间了，所以郑芝龙惊得是目瞪口呆，一时间也有点麻了手脚了。
要知道现如今他郑芝龙之所以能名正言顺的控制福建，最重要的就是他曾经是大明福建总兵官，而绍武帝则是他立足的根本，绍武帝在，他便可以名正言顺的执掌兵马，但是现如今绍武帝突然之间，便弃了他而去，就等于是已经彻底于他决裂，他便不再是什么绍武朝兵马大将军了。
而前段时间因为绍武帝和永历帝的身份之争，他郑家已经和两广的永历朝闹得是兵戎相见，把永历朝上下给得罪了个光，现如今绍武帝也弃他而逃，这就等于让他失去了立足的政治基础，即便是现在他想向永历称臣，估计永历朝也难以再信任与他了。
所以绍武帝的突然逃走，对于郑芝龙来说无疑是一个重大的打击，有绍武帝在，他还有一点政治资本，可以名正言顺的在福建招募兵马，跟大中朝相对抗，但是没了绍武帝，他的身份便非常尴尬了，如此一来，他就不再有合法的身份，充其量也就算是一支私军，什么名分都没有了。
于是听到这个消息之后，郑芝龙被惊得顿时有点手忙脚乱，立即下令派人快马加鞭赶往漳州府，以期能赶在绍武帝逃到广东之前，令漳州府的守军将绍武帝截下来，那样的话他便还有回旋的余地。
可是郑芝龙最终还是慢了半步，就在他的人赶到漳州府的时候，绍武帝一行人已经提前一步逃入了广东，漳州驻防的郑芝龙的兵马，虽然怀疑他们一行人的目的，但是因为带队的乃是时下绍武朝的吏部尚书张肯唐，而且随行的还有都指挥佥事方正明，而且他们声称是奉了圣旨，要前往广东和永历朝议和，故此当地守将虽然怀疑，但是也没有理由截下他们，故此在郑芝龙的军令到达之前，便将他们一行人放过了漳州府，进入到了广东境内。
等郑芝龙的军命到达漳州府的时候，漳州守将想要再追绍武帝一行，已经是为之晚矣，只能眼睁睁的看着绍武帝逃到了永历朝的控制范围之内。
如此一来，郑芝龙便算是没了主意了，于是郑芝龙立即召集他麾下的人等，商议此事该如何处置。
出了这等大事，对于郑芝龙一系的人来说，无疑让所有人都乱了分寸，虽然他们也大多知道，郑芝龙眼下正在和大中朝商议接受大中朝招抚之事，有人便提议，既然现在绍武帝逃离了福建，他们便已经没有了明朝的官身，与其两边受夹板气，倒不如干脆一不做二不休，现在就投顺大中朝拉倒。
但是也有人认为，现在他们投顺大中朝，还为时过早，毕竟大中朝尚未给他们郑军今后的地位以及身份一个明确的答复，现如今便急于投顺大中朝，很显然不是上策，现如今虽然绍武帝已经逃离了福建，但是他们手中也并不是没有牌打，永历朝肯定是不愿意看着他们这样一支实力很强的兵力倒向大中朝的，所以即便是先前他们闹得很是不快，但是只要他们手中有兵有马还有战船，那么永历朝便不会轻易坐视他们就这么投顺大中朝的。
所以有人提议，如果想要卖出好价钱的话，现在可以先投顺永历朝，然后再跟大中朝讨价还价，如果大中朝想要彻底灭掉大明的话，那么就不得不给他们开出一个好的价钱。
郑芝龙听着手下这些文臣武将们的意见，一时间也有点没了主意，本来他是想要现在就答应大中朝的条件，投顺大中朝拉倒，但是因为大中皇帝肖天健不许他私养私兵，这年头手头有兵马，才能腰杆硬，这本钱一旦没的话，他郑家就等于成了俎上之肉，只能任凭大中朝宰割了。
于是郑芝龙思量再三之后，还是决定同时跟两边联络，先看看谁的开价高再说，就在绍武帝逃离福建之后，郑芝龙终于在漳州息兵罢战，并且派出了手下大员紧随绍武帝之后，赶往了广州府。
