废弃物的外观及形式将有所改变 废液中含有高浓度的氯化物
废液中含有高浓度的金属和有机物质
排放出的物体易受到环保法规的管制
磨碎机的噪音大
高浓度的氯化物会造成职业安全的顾虑
无法保证完全消毒
使用的经验极少
投入资本高，回收成本需要十五年以上
化学疗法废弃物、放射性废弃物、病理废弃物无法使用本方法
高温蒸气消毒 一般而言需求的空间较小
操作简单
运作、维护所需成本较低
资本较低
减容80%, 但是质量微增 容量小、处理规模小
有臭味和排水的问题
废弃物外观不变
有可能需要特殊包装和处理
尖锐物品处理后不改变，仍然有安全顾虑
将废弃物利用灭菌釜或高压压缩可能会造成灰锐物品割破盛装废弃物的袋子或容器
病理废弃物、液态废弃物、手术切割物、挥发性化学物质不适用
电磁波灭菌 --消毒时可移动或固定
--减容80％，但是质量增加
--无法辨识的废弃物 系统资料相当有限
不能完全消毒，只能视为杀菌的过程
增加的蒸汽会造成重量的增加
病理废弃物、低放射性废弃物或化学疗法废弃物不适用
卫生填埋 卫生填埋法易与生活垃圾的卫生填埋法混淆，容易产生管理漏洞，造成污染影响，因此该法在国际上不推荐使用
从上表可见，综合各种因素，高温焚烧方法因对废物的破坏最为彻底、减容效果最好而最为有效。
在实际处理中，各种处理技术在处理各类医疗废物时也有一定的适应性和局限性，具体情况可参见表5。
表5 各种医疗废物处理方法对废物的适应性
技术 感染性废物 解剖废物 锐器 药品 细胞毒类废物 化学药剂废物
回转窑焚烧炉 О О О О О О
单燃烧室焚烧炉 О О О × × ×
热分解焚烧炉 О О О 可以处理一小部分 ×（现代化焚烧厂可以处理） 允许一小部分
等离子体法 О О О О О О
化学消毒法 О × О × × ×
高温灭菌法 О × О × × ×
电磁波灭菌法 О × О × × ×
卫生填埋法 О × × 可以处理一小部分 × ×
注：О表示可以处理，×表示不可处理
