次年正月，在短暂的回浙省亲之后，即奔赴赣州上任。在赴赣途中，曾经遇到流贼数百，王守仁当即表现了他果敢的一面，由此也可看出他在对待流民为盗问题上的态度。
乃连商船，结为阵势，扬旗鸣鼓，如趋战败。贼拜于岸，呼曰：“饥荒流民，乞求赈济。”阳明泊岸，令人谕之曰：“至赣后，即差官抚差。各安生理，勿作非为，自取戮灭。”贼俱散归。
王守仁抵达赣州后，马上一改前任招抚太滥的做法，招抚并用，自正德十二年初至十三年月间，平定了南赣地区的所有叛乱。
正德十二年正月，剿平福建漳州附近的乱事，斩贼首詹师富，福建沿海之寇悉平。之后经过半年的休整，王守仁又于正德十二年十月开始对横水、左溪、桶岗的盗贼用兵。这三地地处南安府的南康、大庾与上犹三县之间，西接湖广的贵阳，南领广东南雄府，形势险峻，贼势颇为强盛，而王守仁利用地方势力，调动三省兵力，先后平定了这三地的盗贼，擒斩首领谢志山、蓝天富等。之后，正德十三年正月又远征南部的三浰，三月“袭大帽山、浰头诸寇，擒斩寇首五十三人，从寇两千余人。后于九连山，以奇计袭敌，寇接擒之，抚其降酋二百余人。”通过以上军事行动，王守仁在一年多的时间之内，一举把骚扰南赣地区数十年之久的盗匪活动全部剿除，对朝廷来说功劳甚大，而王守仁任在南赣巡抚时所配合武力剿除盗贼，还施行了一系列的措施，对赣南地区历史发展的影响更加深远。
一、设立新县。正德十三年，在剿灭了横水、左溪、桶岗等地的盗贼后，王守仁便奏请在南安府西南设立新县。
