康熙年间，中俄的冲突转移到黑龙江上流，这是上节已经说过的。除哥萨克的侵扰外，中俄之间又加上根特木尔（Gantimur）问题。此问题的原委颇不易明。根特木尔乃达斡尔头目之一，原住尼布楚附近，曾向中国进贡，中国亦曾授以佐领职衔。俄人占据尼布楚以后，根特木尔遂率其部落迁居于海拉尔河及甘河左右。顺治十二年（1655）呼玛尔之役，他率部助清，但临阵不前。战后，他回尼布楚降俄。康熙五年（1666）及康熙九年（1670），宁古塔的疆吏曾派委员至尼布楚索根特木尔。俄人始终拒绝引渡，说他既原居尼布楚，就该算是俄王的臣民。双方所以这样重视根特木尔，因为他的向背足以影响当地一般人的向背。尼布楚的总管阿尔沁斯基（DanielArshinsky）于康熙九年也派了一位使者到北京来报聘。巴伊科夫出使的失败足证当时中国如何不明世界大势，这一次又表明俄国人之不懂中国国情。使者是米洛瓦诺夫（IgnashkaMilovanoff），一个不识字的哥萨克！阿氏给他的训令更加可笑，大意谓各国之汗及王多求大俄罗斯、小俄罗斯及白俄罗斯的大君王阿列克谢·米哈伊洛维奇（AlexeiMikhailovich）的保护，大君王除概予保护外，且优加赏赐。中国的皇帝也应求大君王的保护，并应时常进贡及许两国人民自由通商。米洛瓦诺夫到北京以后，在理藩院被质问一番。他曾否执行训令，理藩院得何印象，作何感想，我们无从知道。康熙许他陛见，但所行的是跪拜礼。最后清廷颁一封敕谕，要尼布楚的总管严行约束部属，禁止他们侵扰中国边境。这段往来好像两个互不相识的人对说互不相懂的话，这样的外交是得不着结果的。
康熙十一年（1672），清廷又派人到尼布楚去送信，要求俄国送回根特木尔。这信是用满文写的，尼布楚及莫斯科均无人能翻译，但俄国政府根据尼布楚的报告，以为中国要求俄国派使来华交涉。康熙十四年（1675）二月，俄王遂派尼古拉·加夫里洛维奇·斯帕法里（NicolaiGavrilovichSpafarii）。斯氏有出使日记及报告与函件，这些材料不但是中俄关系史的好史料，且间接对当时中国的内政，如三藩战役及天主教传教士的地位，有不少新知识的贡献。本文限于中俄在东北的冲突，故可从略。斯氏于康熙十五年（1676）六月抵北京，交涉共历三月，绝无成绩而返。中国对斯氏要求二事：送回根特木尔及令哥萨克退出雅克萨；斯氏对中国的希望包括通商和通使，这是双方的实在目的。但斯氏在北京的交涉可说未入正题就被种种仪节问题阻止了。最初斯氏坚持亲递国书于皇帝，后虽退步而呈递于理藩院，但陛见的时候，不肯跪拜，正式交涉简直未进行。在归途中，斯氏曾致书于雅克萨的哥萨克，嘱他们不要骚扰，但未见发生效力。
