辩证法对理论思维的前提批判，不仅是指向形式逻辑和经验常识的，而且是指向科学的。它在对科学的前提批判中，更为深刻地揭示理论思维前提的内在矛盾，更为鲜明地表现出自己的批判本性。
（一）科学作为理论思维的前提
科学是人类的一种活动，是人类把握世界的一种基本方式，是理性和进步的事业。
科学作为人类的一种活动，它是人类运用理论思维能力和理论思维方法去探索自然、社会和精神的奥秘，获得关于世界的规律性认识，并用以改造世界的活动。
科学作为人类把握世界的一种基本方式，它区别于对世界的宗教的、艺术的、伦理的、常识的和哲学的把握，是人类运用科学的思维方式和科学的概念体系去构筑科学的世界图景的方式。
科学作为理性和进步的事业，它是科学的思维方式和科学的概念系统的形成和确定、扩展和深化、更新和革命的过程。科学发展过程中所编织的科学概念和科学范畴之网，构成了愈来愈深刻的科学世界图景，也构成了人类认识世界的愈来愈坚实的阶梯和支撑点。科学的发展“代表着一条抽象思维能力迅速进步的指示线。它已导致具有最高完善性的纯粹理论结构，……它已把人类的思维训练到能够理解以前几世纪中有教养的人所不能理解的逻辑关系”[19]。
科学本身是对常识的超越。它不满足于对经验的常识性描述，而要求探寻经验对象的根据、本质和规律，并形成解释经验对象的概念、命题和原理，即有组织的和系统性的知识体。科学不仅是解释，也是预见。它依据自己关于对象的规律性认识，逻辑地推论对象的发展趋势以及新现象的产生。
科学所回答的问题，可以分为“是什么”和“怎么办”这两大方面，即陈述关于世界的各种本质性的和规律性的认识，并以这些认识成果为基础而规范人们在各个不同领域的思想方式、行为方式和行为准则。
科学作为理论思维的前提，它要求思维与存在在规律层次上的统一，因而也蕴含着更为深刻的思维与存在的矛盾关系。
科学并不是某种超出人类活动的自我存在的实体，恰恰相反，科学就是人类的科学活动及其结果即科学理论。在人类的历史性的科学活动中，科学家们总是以各种不同的概念框架、解释原则、研究方法、价值观念和审美意识等为“前提”，而形成其关于世界“是什么”的各种知识和“怎么办”的行为规范。但是，科学自身并不去反省这些“前提”，也不去追问诸如思维为何能够表达存在、思维所表达的存在是不是自在的存在、思想的客观性如何检验与证明、概念的运动怎样反映存在的运动、思维主体的知情意在反映存在的过程中如何统一、科学的发展怎样变革人类的思维方式等思维和存在的关系问题。科学是把这些理论思维的前提问题当作无须反省和解释的东西而隐含于科学活动和科学理论之中。
在通常的理解中，科学是一种“建立在事实基础上的建筑物”。因而，人们往往把科学看作一种纯粹“客观的”、“中性的”、“确定的”东西。似乎科学活动所使用的概念和方法不是人类历史活动的产物，似乎科学活动所凭借的观察和实验与观察和实验的主体无关，似乎科学理论所提供的世界图景具有终极存在的性质。因此，人们在对待科学的时候，在把科学理论作为推理前提的时候，往往“忘记”了科学也是人类的历史性活动，“忘记”了科学活动和科学理论中所隐含的各种不同的概念框架、解释原则、研究方法、价值观念和审美意识，“忘记”了科学自身的历史性。
显然，这里所使用的“忘记”一词，指的是批判意识的匮乏。辩证法对科学的前提批判，就是要揭示隐含于科学活动和科学理论之中的“前提”，凸显这些“前提”的内在矛盾，从新的视角、以新的方法、用新的理论去重新理解理论思维的“不自觉的和无条件的前提”，从而变革人类对人与世界相互关系的理解，实现科学以及哲学在逻辑层次上的跃迁。
