独立经营的专利局博物馆，按照其连任馆长伍德克夫特希望的方式在自由发展。在“布朗普顿锅炉”博物馆南部狭小的空间内，总会有一些空间被莫名其妙地用于部分藏品的展览，如马修·博尔顿（MatthewBoulton）的索霍厂制造的博尔顿和瓦特的蒸汽机（1788），普芬·比利历史悠久的机车（约1814）和火箭（1829），以及一组阿克莱特纺织机。科学博物馆难以再开发出空闲的空间且大部分区域都未经处理，因此展示的空间非常有限。即使那些应该支持展览的人也无动于衷。《工程》（Engineering）周刊的编辑在1869年写道：
在南肯辛顿区一栋破旧的贝壳状建筑物内，杂乱无章地堆放着一堆连基本分类都没有的藏品，这其中许多是我们国家拥有的早期工程师和发明者最宝贵的遗物。这栋简陋的棚式建筑不仅规模极小，而且采光也不好，甚至连最基本的防火设施都没有。[1]
这听起来更像今天的“开放储存”，事实上，可能远没有那么好。在当时，专利局博物馆是仅存的铁制矮楼建筑物，这种建筑物大部分都在1867年被拆除以便在伦敦以东的贝斯纳尔格林（BethnalGreen）重建（重建的这些建筑物现在属于儿童博物馆）。对于其余单独存在的遗留物品，科学博物馆的收藏方法（称之为政策可能还为时过早）并没有发生什么改变，尽管最后物品的摆放被略微整理了一下。
1871年，曾负责过1851年展览的皇家委员会在南肯辛顿举办了国际展览系列中的第一场展览。不像1851年和1862年的两次展览那么全面，此次展览的所有展品都被摆放在新的建筑物内，即园艺学会花园南端的东西两侧，分别被称为东展厅和西展厅。本次展览在1874年最后一次展出完成之后结束。两年后，西展厅和南展厅的一部分用来放置科学仪器藏品。在展览尾声，许多展品都被留在了南肯辛顿博物馆。这些展品形成了“科学藏品”的核心。“科学藏品”被永久地放置在了西展厅。船舶模型、海洋发动机模型以及机械模型在此时也被添加到藏品中，并被放置在南展厅。所有这些科学藏品数目的扩大使公众的视野聚焦到未来科学博物馆正在兴起的事实上。
显而易见的是，科学博物馆即使没有继续扩大藏品数目的计划，对展览空间的需求仍在增长。这种需求得通过占用现有的用于他用的建筑来达到满足或至少得到缓解。当然，撤掉那些没有太大展示意义的展品也不失为一个好的缓解办法。比如，1881年，科学博物馆就将关于军火的藏品全部撤出并转移到了谢菲尔德公共博物馆以及伯明翰免费图书馆和博物馆。1883年，那些在实际应用中早已过时的部分建筑材料和建筑模型的藏品也被撤出了。[2]两年后，大部分留下来的展品都成了滞留品，因为那些暂时安置藏品的外围木质通道被拆毁了[3]，这些滞留品只是被安置在了储存室的箱子里。
专利局博物馆的合并进一步增大了科学博物馆对空间需求的压力。有人认为，有充分的理由证明存在一笔可供丢弃的好交易。科学艺术部于1883年12月任命了以约翰·斯拉格议员（JohnSlaggMP）为领导的委员会以实施清查。委员会于1884年3月公布清查报告。报告显示，大约600件藏品被保留下来，72件借来的藏品被归还给相应的主人，另外的420件藏品被放置在储存室等待处理。尽管如此，在选中的展品可以从马路对面搬进“布朗普顿锅炉”博物馆之前，南展厅和西展厅的展览还有相当多的重组工作有待解决。该部门1855年的报告显示这些展品将会与科学藏品合并，未来将属于科学博物馆管辖，这一举措终于在1886年年初正式实施。
