更述方便道升进分，此部分从数息、相随、止、观、还、净六门详述了升进过程和方法。经文旁注只述前四门，从“于上观察已”以下至“是名上回转，明智所称说”[2]述回转，即还门，此后述“无垢清净念”[3]为净门。经称“修行观风大，造色从彼生”[4]，认为风是能造色之物，不是造色所造的物，“非彼造色已，而复有种大”[5]，这里含有以风为万物之始基的意味。阿那（安那）为入息，般那为出息。出入息皆从脐处开始，类似于深呼吸。呼吸是人的命根，故行数息亦是对治生死。出息可以开通人的毛孔诸窍，从这一意义上出息应在前，因为先开通息道才能呼吸。毛孔开净之后便可行入息，此后入息在前。值得注意的是，这种不用口鼻，而用毛孔呼吸的内息法，与道家的胎息非常相似。进入升进阶段，出入息渐渐消失，逐步开始用身上毛孔呼吸，即内息，如此便进入三禅、四禅境界，到四禅时呼吸已止。数息升进的最终目的是回转入不共地、究竟地，从而得“无垢清净念”。
再述胜道升进分，此部分对功德进行了解释，“智者开慧眼，说名为功德”[6]，功德即是智慧，这种以智慧为功德的思想对后世亦有影响。智慧功德，具摄止观，可以使身喜乐，令心安隐。自地善根力，可生他地功德，能摄四念处、八背舍、十一切入及禅定神通等一切善法。故应常修自身，令善根增长，智慧圆满。若“现而不触”[7]，学而不修，则空无功德，如同华而不实之树，又如远方之水火，虽见而无益，不能解渴取暖。胜道即是智慧（观），“慧说为胜道”[8]，此胜道功德能起诸多妙相。观想一曼荼罗清净光相在上，向下充遍四体，令自身极为柔软，尔后又从身中出来，渐渐向下，随其善根之力，令远近扩展，成一大曼荼罗，继而复归本处，然后又流散十方，成功德十相，每一相又复变为十相，于其边际又生诸多妙相，妙相边际又生诸相，如此无穷扩展，生种种杂相，继而诸杂相自相渐灭，唯存总相，杂相既灭，转归寂静，然三曼荼罗本相（初曼荼罗在上，远近所成曼荼罗居下，复还本处所成曼荼罗居中）仍存。然后系念出入息，使入息三摩地充满下方，出息三摩地充满上方，再令二者俱遍十方。如此系心修习，可得胜道升进。
又示方便道决定分，善于观念出入息，对之分别明了，具最胜无上智，即为决定。通过正观出入息，得到诸法无常、无我、苦、不净的结论，如此远离一切颠倒妄见，作真实观，即是决定。此部分还述及呼吸的长短问题，认为初禅中息长，由不舍诸依之故；二禅息渐短，已舍诸依故；三禅以身上毛孔呼吸，故“满身遍觉知”[9]；四禅不再呼吸空气，故最短。此长短是指呼吸空气的量，身心越安静，所需空气越少，故越短，此以短为佳。而就呼吸本身时间上的长短而言，如负重上山，呼吸必然短促，上山之后，休息一阵，其息自然变长，又如壮士射箭，力能致远，劣夫援弓，力弱射近，故此处以长为善。通过调理呼吸，即可渐次进入根本四禅，获得决定。
