宁夏贺兰山自然保护区维管植物没有仅分布于贺兰山的特有属，但有贺兰山所在的阿拉善—鄂尔多斯地区特有属或亚洲中部荒漠特有属，主要包括1个鄂尔多斯特有属，即蒺藜科的四合木属，分布于贺兰山北段西麓。有1个阿拉善—鄂尔多斯特有属，即菊科的革苞菊属，分布于宁夏贺兰山自然保护区南段。上述2属，均为单种属。此外，还有2个亚洲中部荒漠特有属：豆科的沙冬青属，本属含2种，宁夏贺兰山自然保护区1种，分布于汝箕沟以北山地沟谷；菊科的紊蒿属，为2种属，宁夏贺兰山自然保护区有1种，分布于北段山麓。此外，宁夏贺兰山自然保护区分布有中国华北特有属：虎榛子属；中国华北—东北特有属：文冠果属；中国华北—西南特有属：阴山荠属。
目前，发现宁夏贺兰山自然保护区种子植物有贺兰山特有和近特有种47个。其中，仅分布于贺兰山的特有种21个。以贺兰山为中心，分布区可扩展到周边临近地区的贺兰山近特有种26个。这些特有和近特有种隶属于26科37属，占种子植物的7.1%。石竹科、菊科种类最多，均为7种。其次是豆科4种。其他科仅含1～2种。
4.植物生态类型的多样性
虽然贺兰山处于干旱区，但贺兰山有海拔3000m以上的高大山地，极大地丰富了该地区的生物多样性，并提高了中生植物类型的比例，中生与旱生植物达到61.3%，但旱生类型，包括中旱生、旱生及强旱生类型仍占32.4%，由此可见该地区植物区系的强烈旱化特征。
（二）主要植被类型
贺兰山是我国温带草原区与荒漠区的分界线，植被类型比较复杂，包括草原和荒漠、针叶林和疏林草原、各种灌丛、草甸和落叶阔叶林。
山地草原分为典型草原和荒漠草原两个亚类。典型草原以长芒草、大针茅和阿尔泰针茅分别为建群种，由60余种植物组成，每个植物群落中出现的种数差别很大，最少的仅有4种，最多的达21种。荒漠草原以短花针茅、戈壁针茅、中亚细柄茅、灌木亚菊为建群种或共建种，在山麓地带形成纵贯南北的荒漠草原亚带。该类草原的植物种类比较复杂，每个群落中有植物5～19种，多为10种左右。
荒漠是一类旱生特征比草原更强烈的植被类型，主要分布于山前平原地带，仅见于石炭井周围，主要为红砂、珍珠猪毛菜和松叶猪毛菜组成的小灌木或半灌木荒漠，局部地方有以霸王或沙冬青为建群种的灌木荒漠分布，组成本地区荒漠植被的植物约59种。
疏林草原是一类分布于贺兰山低山半干旱地带的重要植被类型，它是由草原植物如短花针茅、长芒草、灌木亚菊、刺叶柄棘豆等组成的草被层与稀疏生长的耐旱小乔木灰榆共同组成的一种植物群落。它既不同于落叶阔叶林，也不属于草原，是一种具有独特区系组成、结构特点和外貌的植被类型。分布区海拔1600～2000m，介于山地草原带与山地针叶林带之间，形成一个完整的山地疏林草原带。
低山区干旱，中山区与亚高山温度低，限制了落叶阔叶林的发育，所以本类植被面积小，分布零散，且很局限，群落中树种单一，结构比较简单。主要类型为分布于山地针叶林带中的山杨林，多系油松林或青海云杉林破坏后出现的次生纯林。
二、动物多样性
（一）多样性特征
宁夏贺兰山国家级自然保护区的野生动物在地理区划上属于蒙新区西部荒漠亚区的东端，除与东部草原亚区相邻外，还与青藏区、华北区相距不远，因而动物区系成分混杂，有高山森林动物，也有荒漠草原动物。
