至正四年（1344），贡师泰服阕，出任江浙行省绍兴总管府推官，进入仕途的第二阶段。绍兴路下辖二州六县，地大民众，狱讼号称繁剧。而推官一职，专详审理刑狱。师泰虽以儒者出任，却“诚以本之，恕以推之，刚断以济之，公正以持之”，所以能够判决疑狱，平反冤案，使得“庭无滞讼，狱无冤囚，豪强慹服，善良赖以为安”。[8]三年任满去官，士民挽留，省、台、宪府荐章交上。好友王袆为作《绍兴谳狱记》，详细记述其政绩。至正七年十一月，贺惟一（蒙古名太平）为中书左丞相，搜罗天下人才之有政誉者，贡师泰以治行为浙东西第一，得复召入朝为应奉翰林文字，参与修撰《后妃》《功臣》列传。九年，史事毕，迁宣文阁授经郎。五月，又扈从顺帝赴上京，兼经筵译文官，曾进讲“君子喻于义，小人喻于利”，反复于义利之辨。十年，迁翰林待制，俄兼经筵参赞官。又南下代元帝祭祀天妃，自直沽至漳州，凡十七所。十一年，代祀事竣，未还，道拜国子司业，“诸生闻公之至，欣悦倍常”。[9]
至正十二年三月，元顺帝接受太师右丞相脱脱建议，下诏：“南人有才学者，依世祖旧制，中书省、枢密院、御史台皆用之。”[10]于是首用贡师泰为吏部郎中，未几，改拜监察御史，分巡上京，平反疑狱。《元史·贡师泰传》云：“自世祖以后，省、台之职，南人斥不用，及是，始复旧制，于是南士复得居省、台，自师泰始，时论以为得人。”十三年，江淮各地爆发反元起义，京师粮食不足。顺帝遣太师右丞相脱脱南征，下诏赦免起义百姓，促使归顺。师泰以吏部侍郎奉使宣喻，并携内帑钱和籴于湖州等路。他不经地方官吏散敛，听任百姓有储粟者自行陈籴，又增粮价2/10，且先付钱，后纳粟，未越月，即得粮六万余石，供给京师。杨维桢撰《吏部侍郎贡公平籴记》，记载其事。[11]改兵部侍郎，巡视整饬京师至上都十三处驿站。当时富者倚权势荫蔽，贫者无援日困。师泰不受请托，历究病原，验富贫，均徭役，使豪贵慑服，数十郡贫困驿户得以苏息。十四年，复出巡涿州、良乡等七驿，均平允当如前。转都水庸田使，再次和籴平江等路，得军储一万石，逾月而事集。
自至正四年任绍兴路推官，至十四年为都水庸田使，贡师泰仕途的第二阶段较为顺畅，成为元世祖之后首位出任中书省和御史台的南士。他也不负众望，虽迁转频繁，职任变化颇大，却能在审理刑狱、教育诸生、整顿驿站、和籴粮储诸方面都做出显著成绩，表现出卓异的政治才能。《贡公神道碑铭》曰，师泰“为政外严内宽，不苛不弛，有古良吏之风”，《元史》云其“于政事尤长，所至绩效辄暴著”，实非虚誉。
