亨利四世没有拒绝胡格诺的要求，因为拒绝就要重燃战火，濒临毁灭边缘的法兰西无法再经受这种折磨。经过反复磋商，双方终于达成协议。1598年四五月间，亨利颁布《南特敕令》，宣布：天主教为法国国教，全国实行天主教礼拜和仪式，恢复天主教僧侣的权利和财产，修复或重建被毁的教堂；加尔文教徒享有宗教自由，拥有与天主教徒相同的公民权，可以担任官职、举行宗教和政治集会（但地点、人数和形式均有限制）、兴办学校和医院，可以与天主教徒通婚。为担保敕令的执行，胡格诺在8年内仍可保有2.5万军队（当时国王只有1万军队）和100多个城堡，如拉罗舍尔、蒙彼利埃和孟托班等，但国王只负担官员的俸禄，所需军费须自理。在巴黎、波尔多、图鲁兹和格勒布诺尔，设专门法庭（在巴黎由16人组成，胡格诺占6人；在其他地方，双方各占一半）负责处理执行敕令过程中涉及胡格诺的案件。
1598年5月2日，亨利四世与西班牙签订了《韦尔芬和约》，重申1559年《卡托-坎布雷西和约》规定的疆界，双方退出所占领土；法国收复加来，西班牙得到康布雷和意大利的萨鲁佐。西班牙的干涉正式结束。
经过几十年的战乱，法国又恢复了和平。《南特敕令》虽然没有彻底解决宗教两派问题，胡格诺还有相当的独立性，实际上是国中之国，仍是一支威胁王权的势力，但敕令毕竟结束了战乱，使法国复归统一。《南特敕令》是西欧历史上继1555年《奥格斯堡宗教和约》之后又一个宽容新教的敕令，对宗教改革运动的发展有一定的影响。
五、专制统治的确立
《南特敕令》初步解决胡格诺问题以后，亨利四世便把政策的重点放在强化专制王权和恢复生产上。他采取果断措施，清除决策机构里的大贵族反对派，另选5名亲信组成秘书处，为国王总揽大权。对于里通外国（西班牙、萨伏依）、阴谋叛乱的比龙元帅，他下令处决（1602年）。1604年，根据财政大臣布莱特的建议，发布敕令，允许缴纳收入1/60年税的官员世袭继承其官职。这样既增加政府的收入，又提高穿袍贵族的地位。亨利四世高度重视恢复和发展农业生产，下令降低人头税，豁免农民积欠的税款，禁止逼使农民以牲畜和农具抵债，同时引进桑树，推广玉米和甜菜种植，并从荷兰请来水利专家帮助兴修水利、排干沼泽、扩大耕地面积。他亲自推荐著名农学家奥利维·德·塞尔的专著《农业园圃和农业管理》。他的财政总监苏利强调，农耕和畜牧是滋养法兰西的**，是真正的宝藏。亨利四世实行保护关税政策，禁止羊毛、蚕丝等原料出口，限制进口外国商品，并发放手工工场津贴，改善交通，鼓励发展本国的工商业。1604年，成立法国的东印度公司。1608年，在今加拿大的圣劳伦斯河下游建立魁北克城。
1610年5月，亨利四世被狂热的耶稣会士弗朗索瓦·拉瓦雅克用匕首刺死，其9岁幼儿继位，称路易十三（1610—1643年在位），由母后美第奇家的玛丽摄政。1617年，路易十三与心腹吕伊纳密谋，从玛丽手中夺权，并逐渐重用有卓越行政才能的黎塞留。黎塞留，贵族家庭出身，其父曾任亨利三世和亨利四世的卫队长。1606年，黎塞留经亨利四世举荐任主教，后升红衣主教；1624年8月任首相，控制大权18年，为巩固君主专制做出了重大贡献。他虽是红衣主教，却把国家利益放在教会之上。他在《政治遗嘱》中说：“我的第一个目的是使国王崇高，我的第二个目的是使王国荣耀。”1620年，一批聚集在太后玛丽周围的贵族阴谋勾结胡格诺发动叛乱，黎塞留说服路易十三坚决镇压。对于实行割据的胡格诺，黎塞留毫不留情。1621年4月，他派兵攻占罗亚尔河两岸的胡格诺城堡，只允其据有拉罗舍尔和孟托班。1627年年底，黎塞留亲率大军攻打拉罗舍尔，并下令修筑围堤使前来支援胡格诺的英舰无法入港。第二年底，该城被迫投降。1629年5月，胡格诺最后一个据点孟托班陷落。同年6月，路易十三颁布《阿莱斯恩典敕令》，名义上仍然承认《南特敕令》，允许胡格诺信仰自由，但必须解散军队和拆除一切城堡。这种将政治与宗教分开的做法收到了积极效果，最终解决了法国的隐患，国中之国不复存在，从而大大巩固了法国的统一和君主专制制度。1626年，黎塞留平定王弟奥尔良公爵的叛乱后，下令一切臣民非经朝廷允许不得召集军队、征收捐税和与外国（包括教皇）使节往来。不久，太后玛丽被流放，后逃往尼德兰。1631年，奥尔良公爵策动功勋卓著的元帅、蒙莫朗西公爵讨伐黎塞留。阴谋被粉碎后，这位公爵被剥夺爵位，判处死刑。1642年，路易十三的宠臣森·马尔斯侯爵与奥尔良公爵合谋反对黎塞留，阴谋败露后被处死，奥尔良公爵被削官为民。
为加强中央集权，黎塞留设立中央各部，选派权力很大的主计官监督地方的行政、司法和财政。这种官职不能买卖、转让和世袭，随时由中央任免。他实行重商主义政策，奖励工商业，支持海外贸易和殖民掠夺。为支持对外掠夺和提高法国的国防地位，黎塞留积极扩建陆海军，使之成为令人瞩目的强大武装。1626年，法国陆军有1.2万人，到1635年增加到13万人。1636年，法国的大西洋舰队和地中海舰队已拥有舰艇约60艘。
在对外政策方面，黎塞留立意打破哈布斯堡势力对法国的三面包围，进而夺取欧洲霸权。他要把法国的疆土扩张到莱茵河畔，恢复所谓“自然疆界”。他先后怂恿、资助丹麦、瑞典入侵德国，1635年起直接参战，最终取得三十年战争的最后胜利，肢解德国，夺得欧洲霸权，大大提高了法国的国际地位。
为了支持内政外交政策，黎塞留一再加税。以人头税为例，1610年为1150万里佛尔，1643年增加到4400万里佛尔。黎塞留把人民比作忍辱负重的骡子，没有丝毫同情心。17世纪30年代，在歧恩、加斯科涅、普瓦提埃、桑通日和诺曼底等地，到处发生反重税反暴政的人民起义，都被黎塞留残酷镇压。
