公立医院普遍存在保持公益性与维持医院财政收支平衡之间的矛盾。突出表现是“以药养医”现象，该现象的根源在于公立医院的体制机制。中国医生多在公立医院就职，而公立医院属于事业单位，收入水平较低，且医疗服务价格偏低，医生无法通过提供医疗服务获得额外补偿。医生处方权可以决定患者用哪些药、用多少药，这些权利给了医生获得药品回扣的机会。落实政府责任，建立科学的医疗绩效评价机制和适应行业特点的人才培养、人事薪酬制度，是今后政府努力的方向。
落实公立医院改革中的政府责任要做到：第一，需要落实政府的管理责任，明确公立医院的基本职责和改革的政策、措施、步骤、方法，并积极加以推进；负责完善公立医院的各项管理制度；负责制定城乡一体化、医院与社区卫生机构一体化的管理体制改革方案。第二，落实政府的保障责任。政府的保障责任主要集中在建立公立医院的经费保障机制；医院基础设施建设和设备购置经费由政府核定拨付；医院来自患者自费的医药收入，不能再由医院自收自支，由政府统筹用于对医院的经费保障或奖励。第三，落实政府的监督责任和引导责任。
中共十八届三中全会明确提出鼓励社会办医，优先支持举办非营利性医疗机构。社会资金可直接投向资源稀缺及满足多元需求服务领域，多种形式参与公立医院改制重组。允许医师多点执业，允许民办医疗机构纳入医保定点范围。如何优化医疗费用结构，避免医疗费用的过快增长、保障医保制度的平稳运行成为政府面临的新课题。民营医院是提供医疗服务的重要组成力量。公开数据显示，截至2013年3月末，全国民营医院已经发展到10166所，比2012年同期增加1302所，增长了14.69%，不过，其诊疗人次和入出院人数仅达到全国医院的1/10，未来民营医院诊疗服务能力仍有较大发展潜力。2014年1月9日的《关于加快发展社会办医的若干意见》明确表示，卫生规划要为社会办医留足空间，允许社会资本参与公立医院改制。经过前期医改，医疗服务发展将进入黄金发展期。
目前非公立医疗机构占比低，未来可望快速发展。“十二五”卫生事业规则指出，2015年非公立机构床位数和服务量均达总数的20%，2014年初非公立机构床位占比约11%。医疗对民营资本开放相应市场，有助于推动医疗服务市场化，让医疗服务回归市场应有的本质，而不是依赖于药品高价获利，医药分开将成为必然。
建立健全支持民营医院的相关政策。目前政府对营利性医院缺乏政策支持。营利性医院与非营利性医院相比，在开办过程中会遇到非常大的阻力，在被核定为医保定点医院的过程中，非营利医院几乎都可以成为医保定点医院，营利性医院却只有60%被核定为医保定点医院。而在提供计划免疫服务，提供妇幼保健服务，参加当地急救等公益性质的医疗业务中，非营利性医院占有较高的比例。
需要充分调整并发挥已有医疗政策的功效。现有的政策既没有发挥营利性的灵活的市场化优势，也没有很好发挥非营利医院的公益性，目前中国医疗市场从高端人群到低端人群都没有获得良好的医疗服务，需要通过发挥相应作用进一步释放医改政策红利。
表4-8 世界各营利和非营利医院占比情况
第一，有序放宽社会力量办医准入标准。引入民营医院，激活医疗市场，促进公立医院的效率提升。民营医院还将满足高端医疗需求，对现有医疗资源起到补充作用。社会办医需要创新机制，在医保定点、职称评定、等级评审等方面给予同等待遇。社会资本办医的创新机制，突破重点是非政府办公立医院主要是国企下属医院的改制，这些医院数量庞大而效率低下，社会资本参与改制，通过企业化改造等一系列措施提升效率，有望达到社会效益和经济效益双赢。
