近十年的流放既摧残了他的肉体, 使他本来就患有的癫痫病明显地加剧; 又动摇了他的革命信念, 使他的思想出现了根本性的转变, 逐渐形成一种“土壤派”(一译“根基派”)理论。“土壤派”是19世纪50年代在俄国形成的一个文学批评流派和一种文化思潮, 代表人物为陀思妥耶夫斯基、格里戈里耶夫、斯特拉霍夫(1828—1896), 对俄罗斯命运的关怀和对俄罗斯民族精神的信念把他们结合起来, 他们以陀思妥耶夫斯基兄弟创办的大型文学政治杂志《当代》(1860—1863)和《时代》(1864—1865)为中心和阵地, 既反对革命民主主义者的唯物主义美学, 又反对“纯艺术派”的唯美主义理论, 而认为俄国社会的动**不安和道德信念的沦丧在于俄国有教养的知识阶层长期脱离人民这一根基, 出路在于知识分子必须与人民结合, 吸取俄罗斯民族性格的根本因素——虔诚的基督教博爱精神和忠君思想, 这样才能使俄国社会各阶层克服内部的矛盾冲突和信仰危机, 重振俄国的经济文化, 甚至为陷于道德精神危机的西欧社会指明新的出路。他们认为, 真正的艺术体现的是人和人类思想, 即基督精神, 它永远能促进社会的道德进步和个人的道德完善, 永远是人民的和民主的艺术, 而普希金是俄罗斯精神和俄罗斯民族性格最完美的体现者, 他的艺术天才无可争议地表现了俄罗斯精神对于全人类兄弟般团结的追求。简而言之, 这一理论认为有文化的上层已经脱离了人民(即“土壤”), 人民也不接受贵族革命家的理想, 所以俄国不具有接受革命宣传的“土壤”, 解决俄国问题的出路, 在于人民忍耐、顺从和笃信宗教, 或者正如米尔斯基所说, 俄国知识社会的救赎之路只能是重建与民众的联系, 接受民众的宗教理想, 亦即接受东正教。
1859年12月, 陀思妥耶夫斯基获准回到彼得堡。回彼得堡后, 他全身心地投入创办报刊和文学创作之中, 创作了许多优秀的作品, 登上了世界文学的高峰。但他过的却是十分辛劳的生活。1864年4月他的第一任妻子患肺病去世, 接着哥哥又因病辞世, 他们创办的《时代》杂志由于亏损严重, 也被迫停刊。一连串的不幸接踵而来, 陀思妥耶夫斯基只有昼夜辛劳笔耕不辍来还债。长期劳累, 影响了他本就不太好的身体, 1881年1月28日因病去世。