1918年4月日瓦戈一家动身到东尼娅外祖父的领地瓦雷金诺村去。这里虽然能维持生活, 但日瓦戈感到心情沉闷。他既不能行医, 也无法写作。他经常到附近的尤里亚金市图书馆去看书。他在图书馆里遇见了女友拉拉。拉拉是随同丈夫巴沙·安季波夫到尤里亚金市来的。巴沙·安季波夫是个工人出身的科学家, 后来参加了红军, 改名为斯特列利尼科夫, 成了红军高级指挥员。他与拉拉虽然近在咫尺却忍受住相思之苦, 不同她见面。日瓦戈告诉拉拉, 斯特列利尼科夫是旧军官出身, 不会得到布尔什维克的信任, 他们一旦不需要党外军事专家的时候, 就会把他踩死。
不久日瓦戈被游击队劫去当医生。他在游击队里待了一年多之后逃回尤里亚金市。他岳父和妻子东尼娅已返回莫斯科, 从那儿又流亡到国外。他找到拉拉, 他们同居了, 两人过着简朴但非常幸福的生活。随着红军的胜利, 党外军事专家已成为镇压对象。首当其冲的便是拉拉的丈夫斯特列利尼科夫, 他已逃跑。拉拉和日瓦戈随时有被捕的危险。他们躲到空无一人的瓦雷金诺去。欺骗过拉拉的科马罗夫斯基来到瓦雷金诺, 在与日瓦戈谈话以后, 日瓦戈欺骗拉拉也会随后跟随他们而去, 科马罗夫斯基便带走了拉拉和拉拉与安季波夫的女儿卡坚卡, 日瓦戈却留了下来。斯特列利尼科夫也到这儿来寻找妻子, 但拉拉已走。斯特列利尼科夫自知走投无路, 思想绝望, 开枪自杀。瓦雷金诺只剩下日瓦戈一人。他为了活命, 徒步走回莫斯科。他在莫斯科又遇见弟弟叶夫格拉夫, 弟弟把日瓦戈安置在一家医院里当医生。后来, 日瓦戈又与玛琳娜结为夫妻, 生了两个女儿:卡帕卡、克什卡。在与好友戈尔东和杜多罗夫长谈后, 日瓦戈离家出走, 在坐电车时, 心脏病发作, 猝死在路上。