刘国轩自缚其绑来向郑芝莞请罪，郑芝莞叹了口气，也没怪罪于他，亲自把绑绳解开，安慰了他几句，让他回营休息。
两天之后，明军数万大军兵临城下。
郑芝莞坚守不战，问计刘国轩。
刘国轩思忖道：“大人，朱由崧诡计多端，我军新败，士气低落，加上兵微将寡，如果明军用大炮攻城，城池怕是守不住了，我们不如放弃思明州，退守厦门岛。我们的优势在海上，在海上收拾他们。”
郑芝莞点了点头，但仍不无顾虑道，“将军言之有理，只是我们弃城而逃，王爷将来要是治我等不战而逃之罪，当如何是好？”
“大人，胜败乃兵家之常事，再说了我们并非不战不逃，这是以退为进之策。撤退只是权宜之计，死守城池，必然全军覆没，城池不保。退守厦门保存实力，只要海战能取胜，我们还有复夺思明州的机会。”
“海战如何打法？明军的水师已经拿下了浯屿礁和双鱼岛。”
“大人，这好办，我们在鼓浪屿设置炮台，然后在四周最狭窄的浅水区修建拦网护网，可破明军水师。”
“好，就依将军之言。”郑芝莞高兴了，立即按照刘国轩的计策，放弃了思明州，将人马撤到了厦门岛上。
明军占领思明州，朱由崧传旨，留下一万人马守城，处理城中战后事宜，然后马不停蹄，督率明军的大队人马开到了海边，安下营寨。
这里最窄处离厦门岛不足十里，朱由崧带着人登高一望，能够清楚地看见对岸深沟高垒的防御工事，炮台战船，戒备森严。
如果把水师调过来，在强大火力的掩护之下，从这里抢岛登陆不是难事，但是此时明军的水师被阻在双鱼岛一带，离这里还有几十里地，水师可从岸上绕过来，但战船却飞不过来，临时造船，耗资甚大，时间也太长。
此时明军和守岛的人马正在进行激烈的海战。
