由此不难看出，实现大学创新，必须要保护好大学内师生个体的独立自由精神。因此，学术自由的价值取向绝不容许忽略，以保护学术自由为目的的学术权力亦不容忽视。放眼世界一流大学，如前所述，其共性，乃是最大限度地尊重了学术自由，保障了学术权力，从而最大限度地激发了大学师生的创造性，进而培养了大批优秀人才，产生了影响人类文明进程的优秀成果。在此意义上，对转型期我国高等教育而言，对照大学内部行政权力长期压迫学术权力，官本位扭曲学术权力，教条主义压抑学术自由[25]的已有制度环境，大学改革固然有制度创新的意蕴，通过制度创新以促进大学创新力的提升，固然是当前的迫切任务。但对借鉴西方一流大学经验而言，促进创新，毋宁说是要深谙其在尊重学术自由、保障学术权力方面的保守意蕴。诚如王英杰教授所言，“大学的重要使命就是储存、传递和创造人类文明。所谓储存和传递人类文明就是保守人类文明。大学的这一使命赋予了大学保守的文化品格。大学要创造新的人类文明就要为了真理而追求真理，追求真理本身就是目的，因此它天然地反对功利，与社会即时的、功利的需要保持一定的距离”[26]。就此而言，我们的制度创新正恰恰在于借鉴西方大学遗传基因——尊重学术自由的核心价值取向的基础上，设计相关的制度规则，呵护学术自由，使教师、学生真正认识到学术自由之于教学、科研的不可或缺，使学术自由真正成为师生教学、科研的精神保障，而不能仅仅停留在形式上、口头上的呼喊，为学术权力正本清源，促进其作用的最大限度发挥。就此而言，大学的学术权力之保障，最终保护的是学术自由，进而促进高校创新。
（四）高校学术权力制度设计的对策
基于上述观点，立足于当前高校内部行政权力挤压学术权力，官本位扭曲学术权力的现实，从改善高校管理，促进高校创新的取向出发，我们认为，从制度层面保障高校学术权力，促进高校创新力的提高，应该从践行大学理念、完善高校领导体制、改善高校内部学术组织等方面出发，提出相关的对策。
1.在大学理念层面，必须将回归学术本位、张扬学术自由作为大学理念的核心
大学理念是大学生存和发展之魂，大学理念的形成与守护，不是靠政策指挥，而是由一代又一代的大学师生在教育教学、追求新知的活动中生发出来。大学理念不仅反映出一所高校独特的文化，更是大学的精神，彰显着大学的独立地位。要从制度层面保障学术权力的有效发挥，就必须从一所大学的理念追求出发，在遵循这所大学理念的前提下，制定出能为全校师生所认同的行事规则，使学术自由成为“学术人”的一种价值理念、理想追求和生活常态，构建以学科为基础、以研究为主导、以学术为本位的基层学术组织。[27]
与此同时，对待学术权力也要“正本清源”，回到学术权力的行使主体上认识，这一点在前面已有相关论述。高校的学术权力是在教师、学生独立、自由探究的基础上生成的学术权力，而不是外部赋予的权力，外部赋予的只能是依学术活动规律而设的制度环境。在组织管理与利益调整上，权力可以赋予、分配、调节甚或夺取；但是就个体自由探究新知的学术活动而言，权利则是生而具有的，因之而生的学术权力也是不可僭越的，学术权力的行使是为学术活动的有效开展服务的。我们在赋予学术权力以宽松的制度环境时，一定不能僭越其本位，任何高校管理者都必须要明白这一点。保障高校学术权力，促进创新力的提高，从根本上来说就是尊重师生主体性，保障其自由、独立品格的发挥，从而保证大学进行知识生产与学问探究的工作能够顺利进行，免受政治权力与官本位的僭越。
2.从我国高校管理的现实国情出发，必须改革与完善高校领导体制
