1993年2月13日中共中央、国务院颁布的《中国教育改革和发展纲要》，是20世纪90年代乃至21世纪初教育改革和发展的蓝图，是建设有中国特色社会主义教育体系的纲领性文件。其中要求：各级政府教育财政拨款的增长应高于财政经常性收入的增长，并使按在校学生人数平均的教育费用逐步增长，保证教师工资和学生平均公用经费逐步增长。这项规定被通俗地称为教育经费的“三个增长”。1994年10月17日，经过一年多时间的调查研究和认真准备，河南省委、省政府《关于〈中国教育改革和发展纲要〉的实施意见》正式出台，明确到20世纪末河南省教育改革和发展的总体思路和目标，提出要深化高等教育管理体制，积极推进高等教育的改革和发展，普通高等教育以政府办学为主，积极促进多种形式的联合办学；除了确保教育投入的“三个增长”，改革教育经费管理体制外，针对河南省教育事业摊子大、发展不平衡的省情，省政府还专门设立实施“211工程”专项经费或基金，从1995年起，省财政安排500万元、省教委安排300万元，作为启动资金，以后每年递增10%以上，主要用于扶持一所重点高校和全省高校10个左右的重点学科进入国家“211工程”，建设2～3个国家级基础研究基地和工程（技术）研究中心。[2]
2.以分级负责的教育管理体制改革为依托，进一步明确了政府间高等教育投资的责任
1993年的《中国教育改革和发展纲要》及1994年出台的《实施意见》提出，高等教育改革重点要放在促进多种形式的联合办学，逐步改变高校“条块分割”办学和管理体制方面存在的弊端上。在中央与地方的关系上，中央管理部门要简政放权，加强地方政府的管理职能，下放给地方办的，要将学校的事业费和基建投资基数划拨给地方政府。以此为依托和契机，1998年，国务院办公厅转发教育部等部委《关于调整撤并部门所属学校管理体制实施意见的通知》，决定郑州粮食学院、郑州工业大学、洛阳工学院、郑州工业高等专科学校、焦作工学院、郑州纺织工学院、郑州轻工业学院、洛阳工业高等专科学校8所地方所属普通高校实行中央与地方共建、以地方管理为主的体制。另外，郑州磨料磨具职工大学、郑州煤田地质学院、郑州矿务局职工大学、平顶山煤矿职工大学、焦作煤矿职工医学院、郑州煤炭管理干部学院、长城铝业公司职工工学院、洛阳有色金属职工医学院8所地方所属成人高校划归地方管理。为搞好省部共建高校工作，河南省成立了省高校管理体制改革和调整领导小组。同时还决定，对共建调整学校，中央划拨的经费如数拨付，省里出台的经费政策一视同仁，保证经费只增不减。[3]中央对办学和投资责任的下放，一方面的确调动了地方政府投资高等教育的积极性，为高等教育事业的发展提供了有力的支撑；另一方面也加大了地方政府的财政责任。尤其是对河南省这样一个教育人口庞大、省属高校居多的经济欠发达省份，中央财政拨款责任的减少，给省委、省政府带来了极大的财政压力。
3.政府财政投资方式进行了改革
《中国教育改革和发展纲要》提出：要改革对高校的财政拨款机制，充分发挥拨款手段的宏观调控作用。对不同层次和科类的学校，拨款标准和拨款方法应有所区别。河南省由“综合定额加专项补助”的拨款办法改变为“零基预算”的拨款办法，力图形成一种更为科学合理的拨款机制。
4.加强对高等教育投入水平的监控和教育经费的管理
从1994年开始，河南省教委会同省统计、财政、审计等部门对各高校教育经费管理使用情况进行审计监督，并将执行情况予以公布。
（四）多元——发展时期（1999-2008年）
1999年，国务院批转教育部《面向21世纪教育振兴行动计划》，提出“积极稳步发展高等教育”的政策。自1999年开始，中国高等教育开始超常规发展。高校扩招对高等教育财政提出了严重的挑战，在这样的大背景下，河南省高等教育也进入了跨越式发展的快车道，但这种超常规的发展使河南省高等教育面临着严重的财政压力，由此也推动了高等教育多项投资政策的出台、完善和规范，形成了高等教育投资主体的多元化模式。在政府财政投资政策方面，该时期在投资力度、投资方向上有明显的调整和改革。
1.在投资力度上，政府投入大幅增加
2004年3月22日，河南省委、省政府下发了《关于加快高等教育改革与发展的意见》，指出进一步加大政府对高等教育的投入。“省、市政府要确保国家举办的高等学校的经费逐年持续稳定增长。确保财政预算内教育经费的增长高于财政经常性收入的增长，使按在校学生人数平均的教育费用逐步增长，并逐步达到全国平均水平。”“今后要实行省与省辖市分级办学，财政供给体制要保持相对稳定，市级政府要强化责任意识，切实保证对所举办高等学校的经费投入。省、市政府要设立高等学校信贷贴息专项资金，用于所属高等学校经批准的教学、科研和基本建设项目的贷款贴息。逐步提高高等学校基础设施投入在省、市政府本级基本建设统筹资金中的比重。”
为了减轻高校经费压力，省政府加大了对财政的投入力度，确保财政预算内教育经费的稳步增长，仅2006年，教育厅预算内财政拨款达26.24亿元，同时加大了对省属高校贷款贴息的力度。2006年，在部门预算安排贴息资金4000万元的基础上，省财政追加贴息经费1.5亿元。
2.在投资方向上，采取重点投资和向重点大学、重点学科和重点实验室倾斜的政策
在《关于加快高等教育改革与发展的意见》中，河南省委、省政府明确提出，要“增加财政专项资金，支持重点学校、重点学科和重点实验室建设，支持‘人才强校工程’的实施。”这样可使有限的资金发挥最大的效益。
