学生在慕课平台注册并完成全部学习及测评任务后，会获得相应的结业证书，并有机会得到用人单位发出的职位邀请。慕课通常颁发的结业证书有两种。一种是慕课机构单方授予的课程证明或荣誉证书，通常是电子的且免费；一种是慕课机构与高校联合授予的课程证书，一般需要经过有监考的考试且收费。这种证书上面都会印上慕课机构和学校的名字与徽章。Coursera的部分教授还颁发自己个人签署的结业证书，但不代表校方。Udacity可以根据学生不同的学习层次颁发不同的证书，有结业、良好、优秀等。[2]然而，在当前，“Udacity已经和美国加州圣何塞州立大学合作推出5门在线课程。能够完成这些课程的学习，并参加具体学校的网上监控考试的学生，可得到大学认可的学分。这些学分可在圣何塞州立大学系统内任意转换，但此类课程需要付费，一般是每门课程150美元。”[3]同时，2013年3月，加利福尼亚州参议院临时主席达雷尔·斯坦伯格（DarrellSteinberg）提出第520号参议院法案，呼吁加利福尼亚州所有公立高等教育机构接受慕课学分，允许学生修习美国教育理事会等课程审核机构认可的慕课学分课程。此外，已有一些社区学院和公立高等大学宣布接受美国教育委员会认可的学分，将修读慕课项目课程取得的学分与修读本校课程取得的学分予以同等程度的承认。[4]诚然，综观其上，在慕课初期是没有“认证”这么一回事的，但考虑到慕课的未来发展，高质量和有效的慕课学分认证可能是慕课发展的必然趋势。无独有偶，欧洲学分互认体系或也为慕课的发展提供了新的机遇。
（三）慕课学分认证存在的难题
就目前来看，慕课学分认证所面临的难题主要来自于技术难题层面、观念障碍层面、体系建设难题层面的挑战。
首先，来自技术层面的难题。在慕课学分认证的技术难题上，上海交通大学副校长黄震做了很好的诠释。黄震认为，慕课如果成为一种校园学习方式将可能对大学文凭的取得产生一定影响，但尚存在技术上的难点：“对校园的学生来讲，通过慕课取得相应的学分和文凭应该没有太大问题，可以通过混合式的教育，鼓励学生去慕课学各种各样的知识点，去享受全球最好的优质资源，同时有翻转课堂，最后还有考试，这样可以更进一步地提高教学质量。但是，对一个社会人或者对外校学生来讲，选修上海交通大学的课程，要拿到所谓的成绩和修课的证明，我认为最大的技术上还没有完全解决的难点，就是怎么通过最后的考试，证明该学生已经学到了各门课应该让其掌握的知识点和应该学到的东西，因为这一点在网上的确很难做到。”这就表明，在慕课学分认证上，技术问题一直是要突破的瓶颈困难。
其次，来自观念障碍层面的难题。这个难题正如斯蒂芬·哈格德（StephanHaggard）在《慕课正在成熟》一文中所说的那样：“很多教育工作者不赞同慕课的价值。从教育工作者们在期刊、专业教育出版社、博客和一般媒体中发表的评论来看，教育工作者之间存在着两派相互冲突的观点。一批狂热分子欢迎慕课带给学习、教学和评估的改变和能量。他们积极地讨论慕课的学习体验以及教学方法的创新模式，并且将大众目光聚集到诸如学习机会、授权、关系网建立以及社区教育上。另外一些持怀疑态度的人冷静思考慕课带来的热潮，认为慕课那些所谓的好处已经被前几代在线远程教育创新实现了，并且慕课的成功包装胜过内容；慕课的形式本身就存在着诸如学习机会、内容、学习质量、认证、教学方法、对较弱学习者的参与，以及对没有特定人际交往技巧的学习者的约束等弱点。”这就从观念冲突上展现出人们对慕课的认识问题，毋庸置疑，也就引发了慕课学分认证上的困难。
